88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2200 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  100 
 
 		 596 aa  1185    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  36.48 
 
 		 604 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 604 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  36.54 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  35.84 
 
 		 604 aa  293  8e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  35.63 
 
 		 604 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  36 
 
 		 603 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  35.42 
 
 		 607 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  35.27 
 
 		 605 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  35.82 
 
 		 605 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  35.27 
 
 		 605 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  35.27 
 
 		 605 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  29.49 
 
 		 661 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  33.75 
 
 		 629 aa  249  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  31.53 
 
 		 617 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  33.1 
 
 		 625 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  32.73 
 
 		 603 aa  210  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  32.27 
 
 		 603 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  31.06 
 
 		 635 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  30.64 
 
 		 631 aa  183  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  32.2 
 
 		 396 aa  181  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  32.2 
 
 		 394 aa  181  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  32.82 
 
 		 628 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 595 aa  167  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  27.3 
 
 		 689 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  27.45 
 
 		 689 aa  161  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  27.45 
 
 		 657 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  25.15 
 
 		 674 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  26.32 
 
 		 604 aa  147  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  28.29 
 
 		 603 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  27.65 
 
 		 616 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  26.43 
 
 		 634 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  26.87 
 
 		 634 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  26.87 
 
 		 634 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  26.54 
 
 		 619 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  26.87 
 
 		 634 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  26.87 
 
 		 634 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  25.82 
 
 		 672 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  26.03 
 
 		 626 aa  138  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  24.79 
 
 		 653 aa  135  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  25.69 
 
 		 680 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  24.73 
 
 		 617 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  26.82 
 
 		 624 aa  134  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  25.72 
 
 		 634 aa  133  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  26.57 
 
 		 628 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  28.67 
 
 		 510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  26.35 
 
 		 627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  26.13 
 
 		 627 aa  126  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  25.73 
 
 		 607 aa  126  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  23.9 
 
 		 721 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  22.95 
 
 		 677 aa  124  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  23.5 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  28.6 
 
 		 621 aa  123  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  24.38 
 
 		 555 aa  121  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  24.96 
 
 		 672 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  23.72 
 
 		 658 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  30.3 
 
 		 704 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  23.44 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 678 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  29.52 
 
 		 678 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  29.52 
 
 		 678 aa  114  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 678 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  29.52 
 
 		 678 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  29.43 
 
 		 678 aa  114  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  29.52 
 
 		 678 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  29.52 
 
 		 678 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  29.22 
 
 		 678 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  27.38 
 
 		 612 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  27.38 
 
 		 612 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  29.64 
 
 		 680 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  29.64 
 
 		 680 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  29.25 
 
 		 680 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  29.64 
 
 		 680 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  29.64 
 
 		 680 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  29.76 
 
 		 682 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  23.72 
 
 		 666 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  26.51 
 
 		 705 aa  103  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  26.25 
 
 		 576 aa  97.4  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  26.32 
 
 		 573 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  29.48 
 
 		 576 aa  88.6  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  30.06 
 
 		 576 aa  87.4  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  26.39 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0264  extracellular ligand-binding receptor  27.06 
 
 		 378 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241284  normal  0.379489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  24.46 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0437  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 401 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0602967  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0404  extracellular ligand-binding receptor  27.63 
 
 		 403 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.706576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0570  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25 
 
 		 394 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  25.1 
 
 		 424 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>