38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0241 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0241  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  33.98 
 
 
321 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
311 aa  62.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  28.5 
 
 
281 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  26.37 
 
 
479 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
328 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 
477 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  26.37 
 
 
479 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 
327 aa  49.7  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 
481 aa  47  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  20.79 
 
 
322 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  28.57 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.65 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  26.55 
 
 
1169 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1624  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 
233 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  22.28 
 
 
312 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  25.63 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.23 
 
 
236 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.35 
 
 
253 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.34 
 
 
309 aa  42.7  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  22.95 
 
 
325 aa  42.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
302 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.35 
 
 
253 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.55 
 
 
326 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
291 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  22.35 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>