22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6394 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  32.29 
 
 		 646 aa  52.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  31.37 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  32.61 
 
 		 917 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  31.52 
 
 		 922 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 		 756 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0348  hypothetical protein  30.21 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  36.11 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  35.48 
 
 		 465 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  30.68 
 
 		 785 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  33.02 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  30.68 
 
 		 768 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4226  hypothetical protein  34.88 
 
 		 417 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0166  hypothetical protein  34.94 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  23.86 
 
 		 651 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  32.08 
 
 		 841 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  23.02 
 
 		 1737 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1852  hypothetical protein  26.32 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.108862  hitchhiker  0.00107714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 		 922 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  27.59 
 
 		 805 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>