13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4226 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4226  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  868    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1896  calcium-binding EF-hand-containing protein  36.82 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1899  hypothetical protein  34.74 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00396633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  34.38 
 
 		 677 aa  222  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0744  putative secreted protein  30.92 
 
 		 478 aa  209  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.65 
 
 		 678 aa  197  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3470  putative thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  29.44 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.0361223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1400  putative monooxygenase  24.62 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0197887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0249  hypothetical protein  31.52 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  decreased coverage  0.00118438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1910  hypothetical protein  24.76 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.489139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3608  putative monooxygenase  21.75 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.842341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  31.68 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  34.88 
 
 		 135 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>