10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1899 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1899  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  917    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00396633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1896  calcium-binding EF-hand-containing protein  59.25 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4226  hypothetical protein  34.74 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.77 
 
 		 678 aa  193  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  29.88 
 
 		 677 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0744  putative secreted protein  25 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3470  putative thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  25.93 
 
 		 442 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.0361223 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1400  putative monooxygenase  22.54 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0197887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3608  putative monooxygenase  21.36 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.842341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1616  hypothetical protein  31.82 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>