74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1533 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
678 aa  1402    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  30.92 
 
 
677 aa  268  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0744  putative secreted protein  36.25 
 
 
478 aa  266  1e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3470  putative thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  32.06 
 
 
442 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.0361223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4226  hypothetical protein  31.71 
 
 
417 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1899  hypothetical protein  31.91 
 
 
438 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00396633  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1896  calcium-binding EF-hand-containing protein  31.01 
 
 
433 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1400  putative monooxygenase  27.19 
 
 
467 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0197887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3608  putative monooxygenase  25.16 
 
 
390 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.842341  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1910  hypothetical protein  25.24 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.489139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1895  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.38 
 
 
191 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4225  hypothetical protein  30 
 
 
204 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0921  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.4 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4240  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.35 
 
 
193 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4302  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.06 
 
 
191 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.111782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0757  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  25.79 
 
 
189 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.41 
 
 
193 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1291  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.38 
 
 
193 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2254  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.16 
 
 
188 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0043335  normal  0.0136474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5923  putative thiol-disulfide isomerase  34.07 
 
 
184 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.71 
 
 
374 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0955  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.06 
 
 
193 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3842  redoxin  25.69 
 
 
193 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5009  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.06 
 
 
192 aa  54.3  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.17 
 
 
185 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787062  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07195  hypothetical protein  24.31 
 
 
185 aa  53.5  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.825172  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4031  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.54 
 
 
191 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  22.36 
 
 
377 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1730  hypothetical protein  25.6 
 
 
196 aa  53.9  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2194  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.01 
 
 
184 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1889  hypothetical protein  25.69 
 
 
183 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000437946  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1461  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.93 
 
 
183 aa  53.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000703412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.81 
 
 
184 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0989  hypothetical protein  25.35 
 
 
193 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00594634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3544  hypothetical protein  23.36 
 
 
199 aa  52.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0035  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.83 
 
 
204 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.85 
 
 
447 aa  52  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0878  hypothetical protein  25.69 
 
 
184 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0321  hypothetical protein  23.04 
 
 
182 aa  52  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0410  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.69 
 
 
183 aa  51.6  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0305173  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.03 
 
 
196 aa  50.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2478  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.73 
 
 
194 aa  50.8  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0242  hypothetical protein  25.44 
 
 
222 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1976  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  25.16 
 
 
202 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2156  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.68 
 
 
187 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2915  hypothetical protein  24 
 
 
187 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00018662  normal  0.0183132 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3487  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.31 
 
 
187 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1367  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  24.81 
 
 
185 aa  47.8  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.150367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1614  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.87 
 
 
188 aa  47.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145031  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1427  anti-oxidant AhpCTSA family protein  24.81 
 
 
185 aa  47.8  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2389  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.1 
 
 
187 aa  47.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0343728  normal  0.47432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.9 
 
 
184 aa  47.4  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.18 
 
 
433 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0215  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  47.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0232  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.94 
 
 
193 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0970667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1438  hypothetical protein  21.57 
 
 
185 aa  47.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  25.76 
 
 
173 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.52 
 
 
209 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0627  hypothetical protein  23.46 
 
 
184 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.650522  normal  0.426152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  25.76 
 
 
173 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  25.76 
 
 
173 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.12 
 
 
196 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0950  redoxin domain-containing protein  26.28 
 
 
185 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626081  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0446  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
196 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  27.45 
 
 
167 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.88 
 
 
188 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2152  Redoxin domain protein  25.77 
 
 
196 aa  45.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.130156 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  27.38 
 
 
173 aa  44.7  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3587  hypothetical protein  22.35 
 
 
184 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.928293  normal  0.0457402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1545  hypothetical protein  22.22 
 
 
185 aa  45.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1940  redoxin domain-containing protein  26.77 
 
 
217 aa  44.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0096  hypothetical protein  23.08 
 
 
194 aa  44.7  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0067  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.39 
 
 
178 aa  44.7  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25 
 
 
189 aa  43.9  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>