85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0757 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0757  thiol-disulfide isomerase/thioredoxin  100 
 
 
189 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.02 
 
 
217 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.527569  normal  0.0758496 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6023  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.42 
 
 
206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.18335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1976  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  33.15 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.575608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06425  hypothetical protein  33.71 
 
 
213 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1905  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.54 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0035  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.55 
 
 
204 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0137  redoxin domain-containing protein  31.12 
 
 
377 aa  98.2  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4144  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.8 
 
 
204 aa  98.2  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.262139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0627  hypothetical protein  30 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.650522  normal  0.426152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3487  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.93 
 
 
187 aa  87.8  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.03 
 
 
209 aa  85.9  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2156  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.53 
 
 
187 aa  84.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5923  putative thiol-disulfide isomerase  29.93 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.532581 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2478  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.42 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1351  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.01 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1461  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.74 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000703412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.55 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1889  hypothetical protein  29.73 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000437946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0921  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.122938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0989  hypothetical protein  26.55 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00594634  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1818  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.33 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.49 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0285  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.57 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0888436  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2152  Redoxin domain protein  26.55 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.130156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1318  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.845811  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0950  redoxin domain-containing protein  27.43 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626081  decreased coverage  0.000095719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4031  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.28 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1730  hypothetical protein  23.43 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1545  hypothetical protein  26.29 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0232  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.43 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0970667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1438  hypothetical protein  25.71 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2855  Redoxin domain protein  25.86 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.603714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07195  hypothetical protein  24 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.825172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4240  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.65 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2254  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.86 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0043335  normal  0.0136474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4302  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.55 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.111782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3526  Redoxin domain protein  23.91 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00360773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3065  hypothetical protein  25.57 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3842  redoxin  22.16 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1496  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.86 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0321  hypothetical protein  25.14 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1614  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.86 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145031  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1367  thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  24.16 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.150367  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1427  anti-oxidant AhpCTSA family protein  24.16 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5009  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.71 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2915  hypothetical protein  21.71 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00018662  normal  0.0183132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0955  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.29 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1940  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
217 aa  62.4  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.529008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2389  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.42 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0343728  normal  0.47432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3524  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.7 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717599  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0156  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.33412  normal  0.373382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0446  redoxin domain-containing protein  21.14 
 
 
196 aa  61.2  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0568  alpha amylase domain-containing protein  24.44 
 
 
207 aa  61.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.155304  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3928  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.92 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.79 
 
 
678 aa  60.1  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.895554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11749  hypothetical protein  23.43 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.208132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2194  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.44 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0502058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2020  hypothetical protein  22.73 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  27.03 
 
 
677 aa  58.2  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0878  hypothetical protein  25.15 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1342  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.86 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0067  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.5 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4225  hypothetical protein  26.8 
 
 
204 aa  55.1  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0234  hypothetical protein  25.33 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1250  hypothetical protein  23.86 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0378  hypothetical protein  26.39 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0285  hypothetical protein  23.81 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1408  redoxin domain-containing protein  25.14 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0884  hypothetical protein  23.42 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.231284  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0096  hypothetical protein  26.59 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25151  hypothetical protein  22.94 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0321  redoxin  22.58 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03071  hypothetical protein  24.02 
 
 
197 aa  48.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3587  hypothetical protein  23.39 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.928293  normal  0.0457402 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02139  thioredoxin-dependent thiol peroxidase  26.42 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.178426  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4022  redoxin domain-containing protein  20.9 
 
 
183 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590081  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6604  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  21.91 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0553  hypothetical protein  25.33 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523774  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0708  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.33 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.851081  hitchhiker  0.00000125723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2250  hypothetical protein  20.45 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0243892  hitchhiker  0.00000211438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0410  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.83 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0305173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0455  hypothetical protein  19.55 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.011803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  25 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  22.22 
 
 
948 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>