21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3696 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3696  peptidase-like protein  100 
 
 		 261 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.826453  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.6 
 
 		 1771 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  29.26 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5249  phospholipase/carboxylesterase  28.9 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0855258  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  29.82 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  28.38 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3911  peptidase-like protein  28.7 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.363292  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  26.27 
 
 		 563 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0514  phospholipase/carboxylesterase  25.19 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.463342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  26.14 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  28.85 
 
 		 1002 aa  51.2  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  24.66 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0409  phospholipase/Carboxylesterase  23.63 
 
 		 277 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2269  hypothetical protein  22.54 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.187168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0912  phospholipase/carboxylesterase  25.41 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3048  phospholipase/Carboxylesterase  27.71 
 
 		 405 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0890  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 		 417 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00284338  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  28.24 
 
 		 325 aa  47  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4144  phospholipase/carboxylesterase  23.81 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.111836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4415  peptidase-like protein  25.6 
 
 		 384 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3746  peptidase-like  23.9 
 
 		 325 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.841468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>