32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1623 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  100 
 
 		 68 aa  133  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5779  ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450157  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3154  50S ribosomal protein L29  51.92 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.621454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0389  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0189  50S ribosomal protein L29  49.02 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.277303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0610  ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.389405  normal  0.580538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05755  50S ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  39.66 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1930  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  38.81 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2056  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000676986  normal  0.393938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0850  ribosomal protein L29  37.25 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2288  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000110804  hitchhiker  0.00284339 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1410  ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1155  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000143802  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2415  50S ribosomal protein L29  41.51 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000251007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0189  50S ribosomal protein L29  37.74 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00253702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  35.59 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  37.29 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 67 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>