45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1568 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 536 aa  1123    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 		 550 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  35.77 
 
 		 556 aa  317  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  35.95 
 
 		 543 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  35.21 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  35.21 
 
 		 540 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  34.44 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  34.44 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  34.44 
 
 		 539 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  33.39 
 
 		 540 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  33.39 
 
 		 540 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  34.44 
 
 		 539 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  34.63 
 
 		 539 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  33.63 
 
 		 539 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  33.1 
 
 		 555 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  34.89 
 
 		 562 aa  289  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  34.73 
 
 		 582 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  34.73 
 
 		 583 aa  259  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  32.66 
 
 		 580 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  21.56 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  23.91 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  50 
 
 		 499 aa  50.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0276  flavocytochrome c  47.73 
 
 		 505 aa  47.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  37.93 
 
 		 634 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.22 
 
 		 496 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  21.35 
 
 		 487 aa  47  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.48 
 
 		 619 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  37.76 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  31.82 
 
 		 644 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  45.65 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  30.23 
 
 		 644 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 495 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29633  predicted protein  43.75 
 
 		 949 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.81 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.31 
 
 		 496 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.36 
 
 		 499 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 		 650 aa  43.9  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  51.06 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  51.06 
 
 		 387 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  34.41 
 
 		 493 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  35.37 
 
 		 493 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  35.37 
 
 		 493 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>