More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2662 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2662  glutathione peroxidase  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0111206  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2679  Glutathione peroxidase  58.56 
 
 		 184 aa  235  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  53.59 
 
 		 158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20790  glutathione peroxidase  50.83 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08510  glutathione peroxidase  51.37 
 
 		 180 aa  194  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.44579 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2663  glutathione peroxidase  53.59 
 
 		 157 aa  191  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.190046  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0968  Glutathione peroxidase  53.33 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000061106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  47.22 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1198  glutathione peroxidase  55.03 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00025984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  49.44 
 
 		 161 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  48.33 
 
 		 161 aa  181  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  48.9 
 
 		 165 aa  180  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 159 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  48.07 
 
 		 165 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 159 aa  180  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  48.07 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  50 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1026  glutathione peroxidase  53.85 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.04413  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0282  Glutathione peroxidase  51.11 
 
 		 158 aa  174  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 164 aa  174  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  49.16 
 
 		 161 aa  174  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 161 aa  174  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  48.9 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  48.9 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  47.9 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 161 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  47.51 
 
 		 159 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 161 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  45.3 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  45 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  45.3 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  46.96 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  46.93 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 165 aa  167  9e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  43.58 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  45.78 
 
 		 160 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  45.78 
 
 		 160 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  48.8 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  45.78 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 161 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  44.64 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  42.46 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  42.46 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  42.46 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  42.46 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  42.46 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  42.46 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  42.46 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  45.78 
 
 		 160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  41.9 
 
 		 159 aa  164  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  45.12 
 
 		 161 aa  164  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  47.22 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  45.18 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  43.33 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  45.78 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  45.78 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  43.33 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  50.3 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  47.22 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  43.02 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  44.58 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  42.46 
 
 		 165 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  44.58 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2146  Peroxiredoxin  49.72 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  44.91 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  44.13 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  44.75 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  46.67 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  44.31 
 
 		 161 aa  161  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  43.98 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  43.02 
 
 		 164 aa  160  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  43.98 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  45.81 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  42.42 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>