27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1532 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  60.18 
 
 
124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  64.81 
 
 
113 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  54.05 
 
 
120 aa  130  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  56.6 
 
 
139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  51.4 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  56.48 
 
 
126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  53.21 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  50.47 
 
 
120 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  50.93 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  52.34 
 
 
122 aa  113  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  47.75 
 
 
120 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  46.79 
 
 
122 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  43.64 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  45 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  41.28 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  36.04 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  36.04 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  35.19 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  32.43 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  28.71 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  27.18 
 
 
118 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3221  hypothetical protein  31.43 
 
 
110 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3375  hypothetical protein  27.14 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  36.67 
 
 
199 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  35.38 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>