75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1299 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  778    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0521  protein of unknown function DUF606  43.07 
 
 		 139 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00661501  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  43.8 
 
 		 140 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  43.07 
 
 		 140 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  43.07 
 
 		 140 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  43.07 
 
 		 140 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  43.07 
 
 		 140 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  42.34 
 
 		 140 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  43.07 
 
 		 140 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  43.07 
 
 		 140 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  43.07 
 
 		 140 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  43.07 
 
 		 140 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3483  hypothetical protein  36.62 
 
 		 154 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3464  hypothetical protein  35.9 
 
 		 154 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.060266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  36.62 
 
 		 154 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3230  hypothetical protein  35.06 
 
 		 154 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000207849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3472  hypothetical protein  35.06 
 
 		 154 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  35 
 
 		 154 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3167  hypothetical protein  35 
 
 		 154 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1792  hypothetical protein  35.92 
 
 		 154 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3512  hypothetical protein  38.18 
 
 		 154 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3257  hypothetical protein  38.18 
 
 		 154 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129406  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  31.06 
 
 		 153 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0520  protein of unknown function DUF606  32.81 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000146462  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  30.3 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  27.1 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  29.14 
 
 		 163 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3799  hypothetical protein  29.53 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000162069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6654  protein of unknown function DUF606  34.09 
 
 		 160 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776475  normal  0.0686008 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  26.92 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  29.51 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  23.08 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  24.37 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5702  hypothetical protein  35.25 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  24.54 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  24.54 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  27.91 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  24.54 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  24.54 
 
 		 323 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  24.54 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  29.6 
 
 		 148 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  21.43 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.19 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1691  hypothetical protein  31.75 
 
 		 152 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.119542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  30.17 
 
 		 145 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  26.9 
 
 		 147 aa  53.9  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  24.11 
 
 		 317 aa  53.9  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  24.81 
 
 		 148 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  29.2 
 
 		 145 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  26.56 
 
 		 148 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  27.69 
 
 		 151 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  29.57 
 
 		 145 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  21.53 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  24.2 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  28.37 
 
 		 146 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  31.21 
 
 		 148 aa  48.5  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  27.87 
 
 		 147 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  20.96 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  32.86 
 
 		 162 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  27.1 
 
 		 147 aa  46.2  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2132  protein of unknown function DUF606  28.57 
 
 		 153 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.947377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  32.91 
 
 		 144 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  27.21 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  29.92 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2131  protein of unknown function DUF606  25.98 
 
 		 158 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  26.61 
 
 		 146 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  27.19 
 
 		 144 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2291  hypothetical protein  30.3 
 
 		 178 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  27.66 
 
 		 143 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  27.66 
 
 		 147 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  28.16 
 
 		 146 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  29.03 
 
 		 153 aa  43.1  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  28.05 
 
 		 151 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>