More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0419 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  66.37 
 
 
449 aa  640    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  65.92 
 
 
449 aa  636    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
449 aa  917    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  66.74 
 
 
448 aa  631  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  65.7 
 
 
450 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  65.7 
 
 
450 aa  626  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  65.7 
 
 
450 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  65.7 
 
 
450 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  65.7 
 
 
450 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  65.7 
 
 
450 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  65.7 
 
 
450 aa  624  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  65.25 
 
 
450 aa  622  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  65.47 
 
 
450 aa  624  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  66.37 
 
 
450 aa  624  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  65.47 
 
 
450 aa  624  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  66.89 
 
 
448 aa  619  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  65.85 
 
 
450 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  64.72 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  64.11 
 
 
450 aa  605  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  62.11 
 
 
450 aa  601  1e-170  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  63.39 
 
 
448 aa  591  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  63.88 
 
 
450 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  62.36 
 
 
449 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  61.25 
 
 
449 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  59.82 
 
 
443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  59.82 
 
 
443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  59.15 
 
 
443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  60.04 
 
 
443 aa  563  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  59.15 
 
 
443 aa  561  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  59.08 
 
 
450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  58.3 
 
 
447 aa  539  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  56.47 
 
 
452 aa  536  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  54.02 
 
 
450 aa  510  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  54.93 
 
 
443 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  55.82 
 
 
426 aa  480  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  53.42 
 
 
438 aa  480  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  55.19 
 
 
445 aa  475  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  46.95 
 
 
446 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  46.94 
 
 
427 aa  393  1e-108  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  44.24 
 
 
431 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  46.96 
 
 
426 aa  379  1e-104  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0085  Glucose-6-phosphate isomerase  41.69 
 
 
424 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  34.84 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  35.44 
 
 
457 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  33.9 
 
 
464 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  34.13 
 
 
453 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  33.71 
 
 
432 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  32.75 
 
 
479 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  34.9 
 
 
468 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  33.58 
 
 
450 aa  208  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  33.94 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  33.94 
 
 
448 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  29.44 
 
 
441 aa  195  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  32.77 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  32.08 
 
 
445 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  32.54 
 
 
437 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  32.36 
 
 
437 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  32.12 
 
 
434 aa  186  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.32 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  33.17 
 
 
460 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  33.08 
 
 
449 aa  179  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  29.31 
 
 
473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  31.94 
 
 
439 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  32.65 
 
 
433 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  30.32 
 
 
430 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  29.55 
 
 
437 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 
448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  30.98 
 
 
447 aa  163  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.83 
 
 
430 aa  159  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  29.84 
 
 
450 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  31.06 
 
 
446 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.44 
 
 
435 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  29.11 
 
 
405 aa  154  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  30.07 
 
 
401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf108  glucose-6-phosphate isomerase  28.93 
 
 
440 aa  145  2e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.621836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  28.65 
 
 
453 aa  143  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  28.96 
 
 
406 aa  136  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  27.71 
 
 
405 aa  133  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  31.3 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  30.16 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  27.39 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  27.88 
 
 
406 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  27.5 
 
 
406 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  26.91 
 
 
406 aa  124  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  27.46 
 
 
444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1105  glucose-6-phosphate isomerase  29.3 
 
 
532 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0530592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4024  glucose-6-phosphate isomerase  30.48 
 
 
528 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1892  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.33 
 
 
950 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08741  glucose-6-phosphate isomerase  32.09 
 
 
532 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00326776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  27.47 
 
 
529 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3269  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  28.89 
 
 
950 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2810  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  26 
 
 
958 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0413323  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  27.9 
 
 
527 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3670  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  27.07 
 
 
950 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2539  glucose-6-phosphate isomerase  28.72 
 
 
555 aa  100  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09931  glucose-6-phosphate isomerase  29.09 
 
 
532 aa  99.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87905  normal  0.412023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4155  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  25.82 
 
 
950 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  28.1 
 
 
527 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0320  glucose-6-phosphate isomerase  28.87 
 
 
532 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0181153  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  28.14 
 
 
527 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>