More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1399 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1399  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 450 aa  895    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106582 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0106  Xanthine/uracil/vitamin C permease  72.42 
 
 		 450 aa  663    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0864  xanthine/uracil permease-like protein  30.73 
 
 		 566 aa  205  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1664  xanthine/uracil permease family protein  31.76 
 
 		 580 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.139365  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0182  aminoacyl-tRNA synthetase, class Ia  32.07 
 
 		 529 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3234  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.95 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  27.31 
 
 		 452 aa  170  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  26.81 
 
 		 451 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  26.61 
 
 		 452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  26.61 
 
 		 452 aa  156  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  27.59 
 
 		 462 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  27.93 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  25.06 
 
 		 468 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2628  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.53 
 
 		 598 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  27.01 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  26.79 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2148  xanthine/uracil permease family protein  26.54 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2223  uracil-xanthine permease  24.49 
 
 		 486 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0466  Xanthine/uracil/vitamin C permease  27.13 
 
 		 549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.304923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0676  xanthine/uracil permease family protein  25.56 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2573  xanthine/uracil permease  27.09 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  26.3 
 
 		 647 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0772  xanthine/uracil permease family protein  25 
 
 		 465 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  27.29 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3698  uracil-xanthine permease  26.39 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0073  uracil-xanthine permease  25.83 
 
 		 464 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  25.11 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4182  uracil-xanthine permease  26.29 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0034  xanthine permease  26.29 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.830973  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0039  xanthine permease  26.29 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2762  uracil-xanthine permease  26.54 
 
 		 500 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.648328  normal  0.727682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3964  uracil-xanthine permease  25.83 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4073  uracil-xanthine permease  25.83 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.853642 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4027  uracil-xanthine permease  25.83 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3954  uracil-xanthine permease  25.83 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4133  uracil-xanthine permease  25.83 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.297531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0538  purine/xanthine transport protein  24.01 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02501  xanthine/uracil permease family protein  25.39 
 
 		 517 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  24.66 
 
 		 825 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3473  uracil-xanthine permease  26.52 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.179383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  27.21 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  26.15 
 
 		 525 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  27.87 
 
 		 566 aa  123  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  26.37 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  26.37 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2644  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.28 
 
 		 571 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  26.37 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  26.37 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  26.37 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  26.37 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  26.17 
 
 		 458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02070  putative transporter  24.78 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3953  uracil-xanthine permease  24.6 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  26.62 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  28.26 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  26.74 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  25.93 
 
 		 525 aa  120  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  28.01 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29700  Xanthine/uracil permease family  25.17 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4873  uracil-xanthine permease  25 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  26.7 
 
 		 505 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1668  uracil-xanthine permease  24.19 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  23.57 
 
 		 489 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4214  uracil-xanthine permease  25.17 
 
 		 462 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  25.76 
 
 		 460 aa  117  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  26.97 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4497  uracil-xanthine permease  25 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  26.68 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  26.68 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  26.68 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3989  xanthine permease  24.67 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03512  predicted transporter  24.22 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.508451  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0051  uracil-xanthine permease  24.22 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  26.52 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3865  xanthine permease  24.22 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4158  xanthine permease  24.22 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  25.48 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5027  xanthine permease  24.22 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0057  uracil-xanthine permease  24.22 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0676705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03464  hypothetical protein  24.22 
 
 		 463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.514946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  27.3 
 
 		 465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  28.1 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  24.22 
 
 		 462 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  27.15 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  25.74 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4150  uracil-xanthine permease  24.94 
 
 		 462 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0234  uracil-xanthine permease  24.32 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.72868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  27.1 
 
 		 451 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4105  xanthine permease  24 
 
 		 463 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  26.46 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  26.46 
 
 		 458 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  26.65 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  25.62 
 
 		 457 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  26.65 
 
 		 451 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  26.23 
 
 		 458 aa  113  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0246  putative transporter  24.62 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0426  uracil-xanthine permease  23.25 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  25.72 
 
 		 455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  24.44 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  27.81 
 
 		 450 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>