22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1217 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  51.38 
 
 
913 aa  934    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  53.04 
 
 
917 aa  1003    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  100 
 
 
925 aa  1877    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  61.08 
 
 
913 aa  1178    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  51.16 
 
 
913 aa  927    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  35.74 
 
 
886 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  33.92 
 
 
1224 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
1223 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  31.28 
 
 
855 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  31.61 
 
 
1222 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  31.25 
 
 
870 aa  352  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  29 
 
 
1263 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  27.19 
 
 
1237 aa  310  8e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  27.88 
 
 
844 aa  306  9.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
1243 aa  294  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  25.83 
 
 
1228 aa  254  5.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  40.66 
 
 
474 aa  52.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  27.71 
 
 
961 aa  50.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  29.77 
 
 
414 aa  48.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  36.21 
 
 
821 aa  46.2  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  36.59 
 
 
414 aa  44.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1924  surface antigen (D15)  33.6 
 
 
516 aa  45.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.112702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>