45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0876 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0876  ferredoxin  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.931688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0768  ferredoxin  61.5 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0628  chlorosome envelope protein J  58.85 
 
 		 226 aa  268  4e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2149  ferredoxin  55.9 
 
 		 226 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1698  ferredoxin  55.56 
 
 		 226 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684927 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0763  ferredoxin  55.36 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1154  ferredoxin  39.39 
 
 		 356 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1374  ferredoxin  39.18 
 
 		 355 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000222813  normal  0.259595 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0893  chlorosome envelope protein I  32.73 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1728  ferredoxin  37.43 
 
 		 349 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1580  ferredoxin  38.6 
 
 		 360 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1733  ferredoxin  36.09 
 
 		 355 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0101582  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0629  chlorosome envelope protein X  43.36 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1172  chlorosome envelope protein I  40.43 
 
 		 145 aa  116  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0769  ferredoxin  38.65 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0877  ferredoxin  39.61 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2148  ferredoxin  34.83 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0765  ferredoxin  33.33 
 
 		 277 aa  99  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1296  ferredoxin  34.84 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1879  chlorosome envelope protein X  34.18 
 
 		 162 aa  96.7  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0036  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  30.23 
 
 		 437 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0479  ferredoxin  38.36 
 
 		 137 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0315  adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 		 580 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0665679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1091  ferredoxin  31.91 
 
 		 160 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.661061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2293  adenylate/guanylate cyclase  28.92 
 
 		 578 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0853444 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1086  ferredoxin  23.38 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1057  ferredoxin  23.38 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0258  ferredoxin, 2Fe-2S  32.22 
 
 		 107 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0642  ferredoxin  30.67 
 
 		 101 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.022084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2054  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  29.11 
 
 		 112 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0511446  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  33.73 
 
 		 605 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  33.33 
 
 		 618 aa  43.5  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  34.83 
 
 		 644 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1822  putative ferredoxin  38.89 
 
 		 92 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0528259  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  32.56 
 
 		 570 aa  42.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3169  ferredoxin  33.85 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  29.21 
 
 		 821 aa  42.7  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  31.65 
 
 		 652 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3757  ferredoxin  30.34 
 
 		 119 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  38.03 
 
 		 610 aa  42.4  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0286  ferredoxin  27.85 
 
 		 113 aa  42  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  33.8 
 
 		 616 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2419  ferredoxin, 2Fe-2S type, ISC system  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  30.49 
 
 		 642 aa  41.6  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01705  Ferredoxin  28.05 
 
 		 107 aa  41.6  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.059878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>