229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0701 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0701  translation initiation factor 2B subunit I  100 
 
 		 354 aa  729    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2073  translation initiation factor, aIF-2BI family  80.23 
 
 		 354 aa  599  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0476  initiation factor 2B alpha/beta/delta  78.92 
 
 		 353 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1805  translation initiation factor, aIF-2BI family  76.7 
 
 		 354 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1662  translation initiation factor, aIF-2BI family  79.26 
 
 		 353 aa  569  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1355  initiation factor 2B alpha/beta/delta  76.14 
 
 		 376 aa  569  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.232366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1783  translation initiation factor, aIF-2BI family  77.78 
 
 		 353 aa  568  1e-161  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.69 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  45.17 
 
 		 346 aa  272  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  45.4 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.64 
 
 		 342 aa  269  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.34 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.32 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.03 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  44.32 
 
 		 346 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  42.9 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.69 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.86 
 
 		 378 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  45.74 
 
 		 344 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  43.1 
 
 		 346 aa  259  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.09 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  41.19 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  43.95 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  42.73 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  42.73 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.69 
 
 		 358 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.48 
 
 		 358 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  42.94 
 
 		 355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.9 
 
 		 339 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.02 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.15 
 
 		 350 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  41.81 
 
 		 344 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.66 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  43.66 
 
 		 350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.71 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.94 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  42.9 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.18 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.57 
 
 		 358 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.61 
 
 		 345 aa  248  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1971  translation initiation factor, aIF-2BI family  40.36 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00568517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.1 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  42.57 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  43.3 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.38 
 
 		 346 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  43.07 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.77 
 
 		 332 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  43.6 
 
 		 358 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.44 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.82 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.88 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.94 
 
 		 349 aa  242  6e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  43.24 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.67 
 
 		 329 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.21 
 
 		 369 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.97 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  40.29 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  43.4 
 
 		 346 aa  240  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  41.21 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  42 
 
 		 351 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  40.51 
 
 		 352 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  41.88 
 
 		 346 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  43.03 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 348 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3292  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.9 
 
 		 356 aa  235  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178535  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  41.49 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  41.53 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  44.31 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  41.71 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.29 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.61 
 
 		 365 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  43.3 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  42.94 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 348 aa  230  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.04 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3517  translation initiation factor, aIF-2BI family  39.7 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.35 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  41.79 
 
 		 327 aa  230  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.35 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.92 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6703  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.43 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  42.04 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.42 
 
 		 353 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.06 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.35 
 
 		 339 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1847  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0721435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2541  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.82 
 
 		 350 aa  225  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 347 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.67 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  41.41 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.43 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  43.43 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  42.51 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  40.48 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.01 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  41.14 
 
 		 365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>