173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0749 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  100 
 
 
422 aa  858    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  43.3 
 
 
407 aa  317  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  40.53 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  29.09 
 
 
412 aa  196  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  33.02 
 
 
418 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  32.06 
 
 
419 aa  186  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  30.21 
 
 
431 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  29.4 
 
 
429 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  28.57 
 
 
475 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  31.01 
 
 
446 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  28.78 
 
 
394 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  36.94 
 
 
490 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  24 
 
 
400 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  25.12 
 
 
495 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  23.85 
 
 
436 aa  97.4  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  23.53 
 
 
465 aa  93.2  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  29.3 
 
 
516 aa  86.7  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  29.15 
 
 
503 aa  86.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  31.11 
 
 
503 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  24.42 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  24.36 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  25.81 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  21.93 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  24.1 
 
 
396 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  22.27 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  22.45 
 
 
456 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  21.96 
 
 
391 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0788  peptidase M23B  25.4 
 
 
408 aa  63.5  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  22.19 
 
 
456 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  21.94 
 
 
419 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  21.94 
 
 
419 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  22.45 
 
 
456 aa  63.2  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.02 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  24.17 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  22.9 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  21.18 
 
 
427 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  21.94 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  21.94 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  21.94 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  21.94 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  21.94 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  25.71 
 
 
438 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  21.94 
 
 
427 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  21.12 
 
 
416 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  26.92 
 
 
372 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  25.19 
 
 
438 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  22.86 
 
 
398 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  22.94 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  25.71 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  27.07 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  32.12 
 
 
369 aa  58.9  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  28.26 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  28.68 
 
 
405 aa  57  0.0000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  31.39 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  24.28 
 
 
434 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  29.92 
 
 
310 aa  56.6  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  22.32 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  26.16 
 
 
445 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  22.49 
 
 
444 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3146  peptidase M23B  29.17 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  22.43 
 
 
411 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  27.91 
 
 
404 aa  55.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  29.6 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  25.26 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  26.67 
 
 
305 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  22.17 
 
 
398 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  26.32 
 
 
373 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  24.79 
 
 
318 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  25.87 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2729  peptidase M23B  42.03 
 
 
389 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  22.38 
 
 
374 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.61 
 
 
430 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  27.13 
 
 
346 aa  53.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  23.09 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  25.55 
 
 
366 aa  53.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  31.45 
 
 
494 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  22.95 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  26.32 
 
 
372 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  27.82 
 
 
441 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  25 
 
 
447 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  19.68 
 
 
427 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  25.66 
 
 
372 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  25 
 
 
447 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  25 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  21.16 
 
 
379 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  23.61 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  20.47 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  21.39 
 
 
405 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  20.47 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  20.47 
 
 
427 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  21.51 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  33.59 
 
 
610 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  27.15 
 
 
370 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.62 
 
 
382 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  28.93 
 
 
423 aa  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  29.6 
 
 
501 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  31.25 
 
 
481 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  30.7 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  30.58 
 
 
537 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>