35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1418 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  43.59 
 
 
238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  43.04 
 
 
239 aa  186  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0224  hypothetical protein  42.37 
 
 
239 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.418253  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  41.7 
 
 
246 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  29.13 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  28.57 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  27.45 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  27.1 
 
 
294 aa  62.4  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  27.67 
 
 
278 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  25.5 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  26.56 
 
 
271 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  24.51 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  25.1 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  31.9 
 
 
286 aa  55.1  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  26.73 
 
 
274 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  30.54 
 
 
286 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  27.54 
 
 
282 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  25.53 
 
 
270 aa  52  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  26.82 
 
 
271 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  22.98 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  23.19 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  23.02 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  27.16 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  25.53 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  25.93 
 
 
284 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 
626 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  25.89 
 
 
292 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 
626 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  25.93 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 
625 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  31.85 
 
 
284 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  23.04 
 
 
284 aa  42.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  24.06 
 
 
246 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.063784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>