More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1367 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1367  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
197 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1180  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.5 
 
 
198 aa  115  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0140  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.81 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0110  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.65 
 
 
195 aa  101  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.186935 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1642  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.96 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  32.43 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 
217 aa  94  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1391  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.68 
 
 
198 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0587  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.57 
 
 
235 aa  88.6  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0123495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  88.2  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.58 
 
 
218 aa  88.2  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.85 
 
 
204 aa  87.8  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  30.1 
 
 
216 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.69 
 
 
217 aa  87.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0364  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.1 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840532  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0132  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.07 
 
 
198 aa  87  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.633264  normal  0.0179048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1911  hypothetical protein  30.32 
 
 
213 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0139262  unclonable  0.00000197593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.77 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  28.35 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1602  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.91 
 
 
248 aa  85.5  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0931799  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0954  integral membrane protein, MarC family  30.65 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.789644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  27.08 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2242  hypothetical protein  30.85 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  0.0116098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  26.18 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1933  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.65 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193827  hitchhiker  0.0000682503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0042  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.36 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1759  hypothetical protein  31.22 
 
 
210 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131249  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1684  hypothetical protein  31.22 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.197685  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1789  hypothetical protein  31.22 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153384  normal  0.0804929 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.34 
 
 
226 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.35 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.34 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1620  hypothetical protein  29.38 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.079521  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1910  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000443138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  27.23 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  27.23 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  31.89 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  27.23 
 
 
214 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.14 
 
 
219 aa  82  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.96 
 
 
203 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  28.65 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.27 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1949  hypothetical protein  30.16 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0303133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1956  hypothetical protein  30.16 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.466227 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2370  hypothetical protein  30.16 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0117247  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  26.8 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1923  hypothetical protein  30.16 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  26.7 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2137  hypothetical protein  30.69 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1917  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.78 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0692726  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1129  MarC family integral membrane protein  28.64 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  30.32 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1832  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.78 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  29.38 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1812  hypothetical protein  30.16 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.26 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1694  hypothetical protein  28.19 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1407  hypothetical protein  31.5 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0713518  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.41 
 
 
213 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0040  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.95 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0101018 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  30.6 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.13 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2476  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.57 
 
 
242 aa  78.2  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.48 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.06 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.02 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1254  MarC family integral membrane protein  28.14 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.06 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.19 
 
 
205 aa  77.8  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.175416  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3711  multiple antibiotic resistance protein  29.08 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.372343  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.43 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2046  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.32 
 
 
211 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.65 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  30.6 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  26.4 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2154  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0620075  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1961  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.7 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0603  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.55 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.708242  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.79 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000442646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2348  hypothetical protein  28.19 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0647314  hitchhiker  0.000000838099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.24 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.02 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.02 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.02 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  26.34 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  26.34 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>