18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2391 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2391  OstA family protein  100 
 
 		 307 aa  637    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2554  hypothetical protein  61.94 
 
 		 313 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0429099  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2797  hypothetical protein  59.61 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2035  hypothetical protein  44.51 
 
 		 396 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000607972  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0205  hypothetical protein  44.84 
 
 		 309 aa  255  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.676053  normal  0.0127531 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1971  hypothetical protein  43.39 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.838381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0196  hypothetical protein  42.72 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06755  hypothetical protein  25.27 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1197  hypothetical protein  25.56 
 
 		 545 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6193  OstA family protein  24.59 
 
 		 709 aa  62.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3019  hypothetical protein  23.33 
 
 		 525 aa  62.4  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2592  OstA family protein  28.67 
 
 		 549 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0594  OstA family protein  29.49 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0493  hypothetical protein  22.65 
 
 		 767 aa  60.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1594  OstA family protein  23.2 
 
 		 560 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0414  hypothetical protein  24.31 
 
 		 626 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.867976 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5216  hypothetical protein  21.5 
 
 		 553 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1309  hypothetical protein  27.66 
 
 		 614 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0453765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>