226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1455 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1455  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 323 aa  669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237279  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  40.86 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  39.2 
 
 		 416 aa  217  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.2 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  40 
 
 		 420 aa  212  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  37.87 
 
 		 527 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.33 
 
 		 393 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.42 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.72 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.54 
 
 		 460 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.22 
 
 		 403 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.33 
 
 		 406 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.33 
 
 		 454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  37.19 
 
 		 344 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  36.51 
 
 		 347 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  40.89 
 
 		 454 aa  195  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.76 
 
 		 472 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.49 
 
 		 433 aa  192  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  35.76 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  35.76 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  35.76 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  35.76 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  35.76 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  35.76 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  35.76 
 
 		 473 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  35.76 
 
 		 473 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.8 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.43 
 
 		 472 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.43 
 
 		 413 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  35.43 
 
 		 473 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.3 
 
 		 419 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.67 
 
 		 420 aa  189  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.75 
 
 		 381 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.77 
 
 		 347 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  36.33 
 
 		 483 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.15 
 
 		 363 aa  187  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  37.11 
 
 		 433 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.97 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
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NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.73 
 
 		 350 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  35.22 
 
 		 439 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_3476  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.65 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.9 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.36 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.16 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.63 
 
 		 415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  35 
 
 		 415 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.68 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.08 
 
 		 433 aa  182  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.64 
 
 		 437 aa  182  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  35 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  34.9 
 
 		 375 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2807  hypothetical protein  39.02 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0544289  normal  1 
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  36.89 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.3 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 439 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.88 
 
 		 427 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.22 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1641  hypothetical protein  37.41 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123258  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.53 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  33.22 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.77 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.59 
 
 		 440 aa  176  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  38.69 
 
 		 457 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  34.22 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  37.73 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.46 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.15 
 
 		 385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.48 
 
 		 353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  35.05 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.19 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  34.92 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  35.74 
 
 		 453 aa  172  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.88 
 
 		 347 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  32.79 
 
 		 402 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.77 
 
 		 353 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  33 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  37.36 
 
 		 366 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 360 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0763  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.83 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.475279  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.33 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.9 
 
 		 440 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.74 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  35.06 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.77 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  37.59 
 
 		 437 aa  170  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  38.96 
 
 		 364 aa  169  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  34.71 
 
 		 437 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_009484  Acry_2376  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.16 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  35.77 
 
 		 730 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  35.77 
 
 		 730 aa  165  8e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  35.77 
 
 		 708 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  35.53 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  32 
 
 		 412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
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NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.43 
 
 		 408 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
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NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.31 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1010  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  32.3 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0471384  n/a   
 
 
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