More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1426 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
396 aa  803    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.97 
 
 
383 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  60.82 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.99 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.53 
 
 
407 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  52.23 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.56 
 
 
395 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 
395 aa  293  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  43 
 
 
414 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.95 
 
 
395 aa  219  5e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.53 
 
 
390 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 
422 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.81 
 
 
399 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.16 
 
 
414 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  34.27 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.21 
 
 
378 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.57 
 
 
384 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.09 
 
 
384 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.04 
 
 
387 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.71 
 
 
400 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
399 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  33.7 
 
 
413 aa  159  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.17 
 
 
400 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.93 
 
 
384 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.99 
 
 
377 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
872 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.89 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0611  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.73 
 
 
375 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.71 
 
 
400 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
400 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  31.71 
 
 
392 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.71 
 
 
400 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.58 
 
 
398 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.17 
 
 
405 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.51 
 
 
380 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  34 
 
 
380 aa  150  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.81 
 
 
400 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.13 
 
 
887 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.33 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2322  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.96 
 
 
904 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0599  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.155589  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0177  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.21 
 
 
383 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000105782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0423  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 
873 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3674  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
887 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0746  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
867 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29 
 
 
400 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4451  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
867 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0443  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  37.76 
 
 
858 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4490  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 
867 aa  143  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3750  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
388 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1983  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
891 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4453  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
867 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.657364  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4115  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
867 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0826  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  33.66 
 
 
387 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.25 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2284  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
892 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4504  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
867 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4267  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
867 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4599  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.01 
 
 
867 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4104  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
867 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  36.62 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4218  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  32.47 
 
 
867 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277718  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
387 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 
389 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0755  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  35.04 
 
 
872 aa  139  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.27 
 
 
395 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  36.27 
 
 
395 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.44 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2128  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.29 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.705476  normal  0.429829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.17 
 
 
382 aa  137  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0629  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
872 aa  137  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  35.92 
 
 
395 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  29.49 
 
 
382 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  30.36 
 
 
382 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  35.92 
 
 
395 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.92 
 
 
395 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  35.92 
 
 
395 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  35.92 
 
 
395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
388 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2510  1,3-propanediol dehydrogenase  35.68 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.4448e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4050  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.02 
 
 
894 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0532224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.36 
 
 
382 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.08 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  29.97 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2819  ethanolamine utilization protein EutG  36.27 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4481  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.71 
 
 
884 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.978497  normal  0.234916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3787  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.797659  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0379  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 
881 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
392 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>