22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0820 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  64.53 
 
 		 913 aa  1220    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  53.52 
 
 		 913 aa  1007    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  64.46 
 
 		 913 aa  1226    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  53.04 
 
 		 925 aa  971    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  100 
 
 		 917 aa  1855    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  34.43 
 
 		 886 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  30.46 
 
 		 1223 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1224 aa  357  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  29.53 
 
 		 855 aa  352  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  31.04 
 
 		 1222 aa  351  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  29.9 
 
 		 870 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  29.47 
 
 		 1263 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1237 aa  305  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  27.92 
 
 		 844 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1228 aa  247  8e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  26.42 
 
 		 1243 aa  233  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  29.55 
 
 		 414 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  30.68 
 
 		 416 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  25.68 
 
 		 414 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  27.85 
 
 		 427 aa  45.4  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  35.53 
 
 		 821 aa  45.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 560 aa  44.3  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>