21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0214 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  280  5.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0646  hypothetical protein  73.08 
 
 		 132 aa  207  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2451  S-adenosylhomocysteine hydrolase  41.35 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1570  hypothetical protein  41.67 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.385078  normal  0.0554336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4096  hypothetical protein  35.48 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1900  hypothetical protein  37.3 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0567258  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3690  hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.758946 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06812  hypothetical protein  33.06 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0716  hypothetical protein  30.33 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0169509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4160  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.65 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.142981 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4456  S-adenosylhomocysteine hydrolase  30.65 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1968  hypothetical protein  29.92 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.815536  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2409  hypothetical protein  41.18 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0199  hypothetical protein  29.37 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0931  hypothetical protein  25.87 
 
 		 172 aa  57  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0743  hypothetical protein  34.94 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1419  hypothetical protein  27.64 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0280  hypothetical protein  27.08 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1777  hypothetical protein  24.14 
 
 		 202 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.692097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0433  hypothetical protein  29.29 
 
 		 203 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.835703  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5264  hypothetical protein  29.75 
 
 		 202 aa  40.4  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00238  unclonable  0.0000182216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>