More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1132 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1132  conserved hypothetical protein, putative iron-sulfur-cluster binding protein  100 
 
 
422 aa  870    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1071  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  69.6 
 
 
421 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1009  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  69.36 
 
 
421 aa  618  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0798  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  69.6 
 
 
421 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1568  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  59.86 
 
 
420 aa  521  1e-147  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000718376  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0385  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.24 
 
 
420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1616  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  57.72 
 
 
426 aa  500  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0607  hypothetical protein  54.74 
 
 
427 aa  488  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.682532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  30.79 
 
 
421 aa  226  9e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.43 
 
 
426 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.43 
 
 
426 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  28.57 
 
 
421 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  29.64 
 
 
421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.21 
 
 
434 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  27.88 
 
 
423 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  27.78 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  30.19 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  27.66 
 
 
446 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.84 
 
 
428 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.01 
 
 
423 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1037  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.34 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.106795  normal  0.550231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0393  hypothetical protein  30.15 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.544976  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  27.34 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.44 
 
 
429 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.59 
 
 
438 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  26.24 
 
 
433 aa  178  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3240  iron-sulfur cluster-binding protein  27.62 
 
 
430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.730489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.54 
 
 
442 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  28.34 
 
 
442 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.67 
 
 
722 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  28.11 
 
 
442 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1993  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.82 
 
 
431 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  28.06 
 
 
430 aa  171  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.11 
 
 
442 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.08 
 
 
453 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.59 
 
 
414 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  28.34 
 
 
442 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0345  hypothetical protein  27.27 
 
 
431 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268241  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.11 
 
 
442 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.11 
 
 
442 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  28.11 
 
 
442 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.11 
 
 
442 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.11 
 
 
442 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.36 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  28.77 
 
 
442 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1863  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.73 
 
 
430 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.38 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  26 
 
 
711 aa  163  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.34 
 
 
433 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  26.89 
 
 
711 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  24.88 
 
 
413 aa  160  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  27.4 
 
 
450 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.66 
 
 
452 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  25.88 
 
 
428 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  25.99 
 
 
445 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2865  hypothetical protein  25.23 
 
 
438 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0818138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  26.1 
 
 
416 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  25.71 
 
 
711 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  26.37 
 
 
431 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  25.46 
 
 
441 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.44 
 
 
453 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.58 
 
 
413 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25.88 
 
 
471 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.11 
 
 
543 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.38 
 
 
447 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2831  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  24.06 
 
 
474 aa  152  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  27.38 
 
 
447 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  25.41 
 
 
447 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.62 
 
 
442 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.1 
 
 
413 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3273  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.41 
 
 
430 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0481549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  25.17 
 
 
432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  25.42 
 
 
712 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  24.59 
 
 
730 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0159  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  24.23 
 
 
458 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.680239  normal  0.157547 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0189  putative glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  24.82 
 
 
453 aa  144  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.103269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5969  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.6 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.26 
 
 
465 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2919  hypothetical protein  23.22 
 
 
472 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.209218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  26.94 
 
 
708 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  24.59 
 
 
416 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2258  hypothetical protein  24.36 
 
 
412 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0882409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5001  hypothetical protein  25.06 
 
 
426 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52714  normal  0.539309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25781  Fe-S oxidoreductase  24.77 
 
 
507 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  25 
 
 
714 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.04 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0680  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  23.11 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.862313  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  25.36 
 
 
717 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  25.3 
 
 
717 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0353  hypothetical protein  25.24 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  24.17 
 
 
717 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3498  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  24.48 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0937  hypothetical protein  24.53 
 
 
432 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  25.48 
 
 
425 aa  127  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0693  hypothetical protein  25.35 
 
 
446 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1748  iron-sulfur cluster binding protein  25.24 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  24.65 
 
 
713 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0202  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  25.06 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0158986 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  25.65 
 
 
425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>