More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0249 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0249  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 407 aa  835    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.985967  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1706  glucose-6-phosphate isomerase  74.45 
 
 		 406 aa  631  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1520  glucose-6-phosphate isomerase  74.2 
 
 		 406 aa  632  1e-180  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1887  glucose-6-phosphate isomerase  74.2 
 
 		 406 aa  630  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2200  glucose-6-phosphate isomerase  54.79 
 
 		 405 aa  454  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.122991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0430  glucose-6-phosphate isomerase  55.39 
 
 		 406 aa  455  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.730091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0522  glucose-6-phosphate isomerase  56.13 
 
 		 405 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0079  glucose-6-phosphate isomerase  53.56 
 
 		 401 aa  427  1e-118  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1108  Glucose-6-phosphate isomerase  40.91 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1472  glucose-6-phosphate isomerase  41.45 
 
 		 402 aa  277  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2902  glucose-6-phosphate isomerase  34.15 
 
 		 477 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19060  glucose-6-phosphate isomerase  33.74 
 
 		 479 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1561  Glucose-6-phosphate isomerase  32.75 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00130425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0540  glucose-6-phosphate isomerase  34.03 
 
 		 437 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.111517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0298  glucose-6-phosphate isomerase  33.5 
 
 		 438 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0874  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 453 aa  199  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2677  glucose-6-phosphate isomerase  31.58 
 
 		 432 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1379  glucose-6-phosphate isomerase  34.29 
 
 		 437 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0464331  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0605  glucose-6-phosphate isomerase  32.06 
 
 		 439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.494251  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1066  glucose-6-phosphate isomerase  31.5 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1843  glucose-6-phosphate isomerase  32.47 
 
 		 450 aa  188  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0631755  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0006  glucose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2369  Glucose-6-phosphate isomerase  31.7 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0456483  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1398  glucose-6-phosphate isomerase  33.24 
 
 		 448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1444  glucose-6-phosphate isomerase  33.24 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2711  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.58 
 
 		 435 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0617  phosphoglucose isomerase (PGI)  32 
 
 		 445 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3597  glucose-6-phosphate isomerase  29.02 
 
 		 450 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2086  glucose-6-phosphate isomerase  31.5 
 
 		 460 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732698  normal  0.0228263 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2126  Glucose-6-phosphate isomerase  30.69 
 
 		 430 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1318  Glucose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 437 aa  170  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.425601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2801  phosphoglucose isomerase (PGI)  30.75 
 
 		 445 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0751  Glucose-6-phosphate isomerase  30.13 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2202  Glucose-6-phosphate isomerase  28.78 
 
 		 453 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0166  glucose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 447 aa  169  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0794  Glucose-6-phosphate isomerase  28.28 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00176722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1484  Glucose-6-phosphate isomerase  29.13 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.875376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2287  phosphoglucose isomerase (PGI)  28.97 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.747954  normal  0.107065 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1622  Glucose-6-phosphate isomerase  30.08 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0851  Glucose-6-phosphate isomerase  28.3 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3003  glucose-6-phosphate isomerase  29.16 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0402  glucose-6-phosphate isomerase  29.01 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000236735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3194  glucose-6-phosphate isomerase  31.27 
 
 		 533 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0241  glucose-6-phosphate isomerase  28.32 
 
 		 449 aa  146  6e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000576365  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0465  glucose-6-phosphate isomerase  30.08 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2857  glucose-6-phosphate isomerase  28.15 
 
 		 449 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5030  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0204  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.157491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4720  glucose-6-phosphate isomerase  29.41 
 
 		 450 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4767  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 450 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5130  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 450 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.705889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5009  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4607  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4630  glucose-6-phosphate isomerase  29.67 
 
 		 450 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4675  glucose-6-phosphate isomerase  27.61 
 
 		 464 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0223011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5037  glucose-6-phosphate isomerase  29.41 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3509  glucose-6-phosphate isomerase  29.57 
 
 		 450 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.229709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5042  glucose-6-phosphate isomerase  29.41 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2470  glucose-6-phosphate isomerase  28.31 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4130  Glucose-6-phosphate isomerase  28.13 
 
 		 448 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0636  glucose-6-phosphate isomerase  28.49 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.712407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0292  glucose-6-phosphate isomerase  28.4 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1445  glucose-6-phosphate isomerase  26.92 
 
 		 450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2252  glucose-6-phosphate isomerase  28.75 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0217  glucose-6-phosphate isomerase  26.89 
 
 		 448 aa  136  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1368  glucose-6-phosphate isomerase  27.72 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.355228 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0355  glucose-6-phosphate isomerase  27.39 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1208  glucose-6-phosphate isomerase  26.85 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000808087  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1256  glucose-6-phosphate isomerase  27.27 
 
 		 447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000664093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0550  glucose-6-phosphate isomerase  26.98 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0981  glucose-6-phosphate isomerase  27.94 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0793539  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0962  glucose-6-phosphate isomerase  27.94 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0420  glucose-6-phosphate isomerase  27.98 
 
 		 452 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0800723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2549  glucose-6-phosphate isomerase  27.48 
 
 		 450 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09691  glucose-6-phosphate isomerase  28.61 
 
 		 527 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.100659  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2811  glucose-6-phosphate isomerase  26.98 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2766  glucose-6-phosphate isomerase  26.98 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0419  glucose-6-phosphate isomerase  27.39 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0451998  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl254  glucose-6-phosphate isomerase  27.49 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000878392  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09721  glucose-6-phosphate isomerase  29.18 
 
 		 527 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.14167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0033  Glucose-6-phosphate isomerase  25.62 
 
 		 431 aa  126  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2242  Glucose-6-phosphate isomerase  24.53 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09711  glucose-6-phosphate isomerase  28.61 
 
 		 527 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1295  phosphoglucose isomerase (PGI)  26.99 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1658  Glucose-6-phosphate isomerase  26.41 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0439  glucose-6-phosphate isomerase  26.37 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0452  glucose-6-phosphate isomerase  26.37 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359723  normal  0.0205249 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1372  glucose-6-phosphate isomerase  27.89 
 
 		 529 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.636312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0910  glucose-6-phosphate isomerase  28.89 
 
 		 527 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.347929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2003  glucose-6-phosphate isomerase  25.65 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.162047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3752  glucose-6-phosphate isomerase  27.73 
 
 		 530 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2767  glucose-6-phosphate isomerase  29.81 
 
 		 528 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3018  glucose-6-phosphate isomerase  28.61 
 
 		 525 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3950  Glucose-6-phosphate isomerase  25.19 
 
 		 450 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3479  glucose-6-phosphate isomerase  27.61 
 
 		 530 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274515 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1975  glucose-6-phosphate isomerase  28.9 
 
 		 515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.264146  hitchhiker  0.00104607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3417  glucose-6-phosphate isomerase  27.89 
 
 		 530 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00179643  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2029  glucose-6-phosphate isomerase  27.07 
 
 		 528 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.624784  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  25.87 
 
 		 529 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2306  bifunctional transaldolase/phosoglucose isomerase  27.2 
 
 		 948 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0592269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>