150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04040 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04040  phosphate transport regulator related to PhoU  100 
 
 
209 aa  428  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.679526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2716  protein of unknown function DUF47  55.77 
 
 
209 aa  255  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21880  phosphate transport regulator related to PhoU  38.76 
 
 
211 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0223149 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  39.71 
 
 
207 aa  154  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0643  phosphate transport regulator  32.54 
 
 
207 aa  121  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.233591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  31.19 
 
 
206 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  30.14 
 
 
205 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  33.99 
 
 
208 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  29.35 
 
 
209 aa  104  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  30.62 
 
 
205 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  30.99 
 
 
209 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  30 
 
 
208 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  33.54 
 
 
205 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  29.85 
 
 
209 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  33.54 
 
 
205 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  31.69 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  32.92 
 
 
205 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  32.92 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  32.92 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  35.41 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  26.73 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  31.71 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  27.8 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  27.72 
 
 
209 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  26.79 
 
 
208 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  31.02 
 
 
211 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  30.11 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  28.4 
 
 
213 aa  88.2  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  28.17 
 
 
211 aa  87.8  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  30.48 
 
 
204 aa  87.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  26.4 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  30.92 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  27.85 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  29.47 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  28.57 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  25.84 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  25.84 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  27.62 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  27.62 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  25.84 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  30.88 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  30.41 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  25.84 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  30.88 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  25.84 
 
 
208 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  30.63 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  31.25 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  25.36 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  33.73 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  26.19 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  27.14 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  26.37 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  30.64 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  33.14 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  28.92 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  24.76 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  28.9 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  25.87 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  27.14 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  25.84 
 
 
208 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  27.86 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  26.67 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  27.14 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  27.14 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  27.14 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  27.59 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  27.14 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  27.14 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  25.36 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  25.36 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  26.24 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  26.24 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  29.24 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  23.78 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  25.71 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  29.88 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0687  hypothetical protein  26.55 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00131316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0702  hypothetical protein  26.55 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000282132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0316  hypothetical protein  25.42 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  25.61 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  26.42 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  27.67 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  23.15 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  23.58 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  24.06 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  24.06 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  26.25 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0386  protein of unknown function DUF47  24.7 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  23.11 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>