33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2196 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1188    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3222  hypothetical protein  55.47 
 
 		 266 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  50.62 
 
 		 546 aa  217  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.97 
 
 		 545 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  39.39 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  40.91 
 
 		 402 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  58.82 
 
 		 201 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  52.46 
 
 		 824 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  58.76 
 
 		 464 aa  127  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  59 
 
 		 804 aa  125  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  51.64 
 
 		 607 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  56.57 
 
 		 192 aa  113  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  53.4 
 
 		 161 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  51.4 
 
 		 234 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  42.59 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  45.28 
 
 		 643 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.14 
 
 		 913 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  40.57 
 
 		 1309 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  38.89 
 
 		 935 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  40.16 
 
 		 922 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1219 aa  71.6  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  31.82 
 
 		 1137 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1217 aa  67.4  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4029  hypothetical protein  24.34 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2400  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1333 aa  63.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0661  hypothetical protein  33.65 
 
 		 222 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00170153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1862  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1086 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0997362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  34.23 
 
 		 224 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0088  hypothetical protein  24.9 
 
 		 237 aa  47  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.190673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  30.97 
 
 		 723 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2549  hypothetical protein  31.71 
 
 		 495 aa  44.3  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12015 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3165  hypothetical protein  29.89 
 
 		 405 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>