29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1975 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  944    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1562  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  48.15 
 
 		 545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1737  hypothetical protein  59.73 
 
 		 824 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1735  hypothetical protein  67.26 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1727  hypothetical protein  56.74 
 
 		 607 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000015164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2761  hypothetical protein  41.38 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2196  hypothetical protein  39.39 
 
 		 577 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3918  hypothetical protein  52.42 
 
 		 201 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00329401  normal  0.0168044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2036  hypothetical protein  66.67 
 
 		 804 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362684 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3838  hypothetical protein  61.11 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2992  hypothetical protein  51.49 
 
 		 192 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3142  hypothetical protein  56.52 
 
 		 161 aa  110  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0357  hypothetical protein  47.27 
 
 		 234 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1736  Annexin repeat protein  47.17 
 
 		 643 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0588103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1744  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.06 
 
 		 913 aa  86.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1274  hypothetical protein  50.6 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0000455544  unclonable  0.00000000267355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1207  Annexin repeat protein  41.82 
 
 		 935 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00485988  decreased coverage  0.0000000555055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2937  Annexin repeat protein  36.62 
 
 		 922 aa  75.5  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4691  hypothetical protein  40.19 
 
 		 1309 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0479337  normal  0.155639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2831  hypothetical protein  35.66 
 
 		 1219 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1384  hypothetical protein  39.22 
 
 		 1217 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2752  hypothetical protein  38.05 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0147993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0689  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1137 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1771  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  57  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4398  hypothetical protein  28.95 
 
 		 723 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6000  hypothetical protein  27.17 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0842  DNA-entry nuclease  38.46 
 
 		 283 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000703488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1492  hypothetical protein  32 
 
 		 1343 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.43088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3813  hypothetical protein  30.09 
 
 		 224 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal  0.356444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>