16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0842 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0842  DNA-entry nuclease  100 
 
 
283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000703488  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1059  DNA-entry nuclease  47.29 
 
 
261 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.711207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1261  DNA-entry nuclease  45.27 
 
 
265 aa  171  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.124263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06680  hypothetical protein  42.16 
 
 
337 aa  166  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000220571  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1644  DNA-entry nuclease  32.59 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000177667  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0163  DNA-entry nuclease  33.7 
 
 
250 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0743  DNA-entry nuclease  36.2 
 
 
391 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0629  hypothetical protein  34.73 
 
 
354 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0298  DNA-entry nuclease  29.24 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0462344  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08080  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.65 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0701644  normal  0.440948 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0686  DNA-entry nuclease, putative  30.54 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000269759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0868  DNA-entry nuclease  33.54 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0114496  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1121  competence associated membrane nuclease  29.94 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000833085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2273  hypothetical protein  29.17 
 
 
436 aa  59.3  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0961  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.31 
 
 
284 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1975  hypothetical protein  38.46 
 
 
454 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.156079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>