19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06680 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06680  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  700    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000220571  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0842  DNA-entry nuclease  42.16 
 
 
283 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000703488  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1059  DNA-entry nuclease  34.47 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.711207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1261  DNA-entry nuclease  37.85 
 
 
265 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.124263  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0298  DNA-entry nuclease  33.46 
 
 
289 aa  105  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0462344  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1644  DNA-entry nuclease  29.35 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000177667  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0629  hypothetical protein  24.18 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0163  DNA-entry nuclease  27.87 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08080  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.7 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0701644  normal  0.440948 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1121  competence associated membrane nuclease  31.45 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000833085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0961  DNA/RNA non-specific endonuclease  28 
 
 
284 aa  65.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0743  DNA-entry nuclease  24.19 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2273  hypothetical protein  29.61 
 
 
436 aa  59.3  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0868  DNA-entry nuclease  30.43 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0114496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  46.43 
 
 
218 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  48.98 
 
 
351 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  42.11 
 
 
271 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0686  DNA-entry nuclease, putative  26.94 
 
 
261 aa  50.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000269759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  42.86 
 
 
222 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>