15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08080 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08080  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0701644  normal  0.440948 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2273  hypothetical protein  39 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1059  DNA-entry nuclease  27 
 
 		 261 aa  89.7  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.711207  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1261  DNA-entry nuclease  32.28 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.124263  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0842  DNA-entry nuclease  29.65 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000703488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06680  hypothetical protein  28.25 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000220571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0743  DNA-entry nuclease  27.78 
 
 		 391 aa  65.9  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0298  DNA-entry nuclease  28.14 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0462344  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0163  DNA-entry nuclease  28.64 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1644  DNA-entry nuclease  27.05 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000177667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0629  hypothetical protein  27.65 
 
 		 354 aa  55.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0686  DNA-entry nuclease, putative  31.2 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000269759  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1121  competence associated membrane nuclease  32.88 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000833085  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0961  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.66 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0868  DNA-entry nuclease  29.5 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0114496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>