More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0033 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_R0033  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.544414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0013  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0003  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.426461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0099  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000201968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0081  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.491812  normal  0.178181 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  92.77 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0003    91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0098  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0692613  normal  0.384897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0097  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0752348  normal  0.27021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0100  tRNA-Leu  91.95 
 
 		 87 bp  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000205949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t73  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t74  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  111  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0001  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA2  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.839683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0005  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 87 bp  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000679583  normal  0.379222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0006  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 85 bp  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0015  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 85 bp  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0012  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.145187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0033  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0082  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0007  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0003  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0038  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 87 bp  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0001  tRNA-Leu  89.66 
 
 		 85 bp  95.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0035  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0610176  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0003  tRNA-Leu  90.8 
 
 		 85 bp  93.7  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4554  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232899  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  92.54 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0063  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna19  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.320912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt10  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0006  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301986  normal  0.331318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0065  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0002  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217421  hitchhiker  0.000407536 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0991  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0063  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200123  decreased coverage  0.00662363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.100426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna27  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0028  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0191582  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0029  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00220383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0030  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00192839  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0005  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206331  normal  0.341408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.002346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0045  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0026  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.344693  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0041  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0042  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00146649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00579317  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0003  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.804113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0003  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.14318  hitchhiker  0.000405393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0044  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00713145  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0043  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00336489  normal  0.0463602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0045  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0150342  normal  0.0447098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0044  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0045  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 87 bp  85.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0249109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0026  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0051  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000888669  normal  0.130057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0052  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000145228  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0053  tRNA-Leu  86.9 
 
 		 84 bp  79.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000187871  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0019  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0038  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  79.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0037  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583149  normal  0.146154 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0038  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360445  normal  0.147869 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0033  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0594182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0034  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0585247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0025  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0013  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0050  tRNA-Leu  87.36 
 
 		 85 bp  79.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0017  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0071  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193194  normal  0.106914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0058  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.031722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0043  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0955991  normal  0.0560674 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0036  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.230012  normal  0.790911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0034  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.947339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0042  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00515288  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1968  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4332  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2521  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000206835  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0072  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0032  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000233164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0041  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  0.0670034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0038  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0044  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00489579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0011  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1753  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1024  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00686094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0142  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0162702  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1814  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0045  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1796  tRNA-Leu  86.21 
 
 		 87 bp  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0107643  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0006  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.26401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>