46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4771 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  100 
 
 
163 aa  331  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  66.26 
 
 
168 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  56.38 
 
 
167 aa  177  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  53.21 
 
 
166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  37.97 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  36.48 
 
 
153 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  28.48 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  31.65 
 
 
150 aa  54.3  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  29.68 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  29.19 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  30.57 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  28.57 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  31.01 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  31.45 
 
 
153 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  28.68 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  32.17 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  33.97 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  32.47 
 
 
157 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  31.41 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  28.57 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  48.98 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  32.82 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  27.61 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  32.61 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  32.61 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  30.64 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  30.64 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  32.19 
 
 
145 aa  44.3  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  28.3 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  43.4 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  48.98 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  29.41 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  44.23 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  31.39 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  32.29 
 
 
151 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  31.16 
 
 
157 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  34.97 
 
 
157 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  25.15 
 
 
162 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  27.74 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  44.68 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  30.43 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  30.06 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  40.38 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  46.81 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  36.62 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>