40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2179 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2179  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
353 aa  687    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.978401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3809  hypothetical protein  43.87 
 
 
366 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4509  hypothetical protein  31.18 
 
 
363 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0202625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  29.28 
 
 
458 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3320  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31.86 
 
 
615 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2117  cell wall anchor domain-containing protein  27.68 
 
 
588 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.853164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1026  hypothetical protein  35.56 
 
 
683 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0776826  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1911  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  31.58 
 
 
310 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3046  cell wall anchor domain-containing protein  32.31 
 
 
598 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.635114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  26.28 
 
 
474 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3367  cell wall anchor domain-containing protein  28.32 
 
 
595 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3121  cell wall anchor domain-containing protein  27.43 
 
 
605 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3798  Prenyltransferase/squalene oxidase  28.66 
 
 
572 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404409  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  30 
 
 
5743 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3011  cell wall anchor domain-containing protein  27.88 
 
 
604 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0165682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2721  hypothetical protein  31.15 
 
 
602 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00844887  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.88 
 
 
607 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3108  hypothetical protein  27.88 
 
 
594 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1726  hypothetical protein  28.4 
 
 
605 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.117249  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3340  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.88 
 
 
588 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00745561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  26.14 
 
 
631 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3573  squalene cyclase  29.31 
 
 
654 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191218  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3326  cell wall anchor domain-containing protein  29.69 
 
 
608 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2295  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.07 
 
 
429 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120475  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  31.82 
 
 
657 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2269  terpene synthase/squalene cyclase  26.62 
 
 
654 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4954  Terpene synthase:squalene cyclase  30.13 
 
 
673 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  28.63 
 
 
677 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  27.68 
 
 
667 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  28.21 
 
 
657 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  28.21 
 
 
657 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0019  Terpene synthase/squalene cyclase  26.43 
 
 
657 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7146  squalene-hopene cyclase  29.2 
 
 
663 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2682  squalene cyclase  27.78 
 
 
654 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1720  squalene cyclase  29.25 
 
 
654 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0718096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3108  LPXTG-motif cell wall anchor domain-containing protein  31.03 
 
 
402 aa  43.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1697  squalene-hopene cyclase  26.91 
 
 
633 aa  42.7  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.633147  hitchhiker  0.000255993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3433  hypothetical protein  31.75 
 
 
547 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  26.43 
 
 
657 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  26.43 
 
 
657 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>