257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0408 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0408  sodium/bile acid symporter family protein  100 
 
 
325 aa  638    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2303  Bile acid:sodium symporter  77.85 
 
 
334 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000645275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1578  arsenite efflux pump ACR3 and related permeases  60.37 
 
 
323 aa  355  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  54.55 
 
 
515 aa  350  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2603  Bile acid:sodium symporter  57.19 
 
 
325 aa  348  9e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000713647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1934  bile acid:sodium symporter  60.06 
 
 
324 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000370816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1293  Bile acid:sodium symporter  55.97 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1411  sodium/bile acid symporter family protein  54.69 
 
 
331 aa  334  9e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.618786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0627  bile acid:sodium symporter  53.7 
 
 
333 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0125709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0197  bile acid:sodium symporter  54.09 
 
 
362 aa  305  9.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0279028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03690  Bile acid:sodium symporter  37.3 
 
 
315 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0554  bile acid:sodium symporter  34.71 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000301487  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0693  Bile acid:sodium symporter  32.79 
 
 
338 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0172  Bile acid:sodium symporter  29.51 
 
 
328 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0310359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0520  arsenical-resistance protein ACR3  26.48 
 
 
350 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4722  arsenical-resistance protein  26.28 
 
 
374 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0467  arsenical-resistance protein  25.51 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5376  arsenical-resistance protein  27.49 
 
 
367 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14670  arsenical-resistance protein  25.43 
 
 
371 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3430  arsenical-resistance protein  27.76 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383745  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0589  arsenical-resistance protein  26.86 
 
 
377 aa  89.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.562176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2405  arsenical-resistance protein  25.57 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.173342  normal  0.119158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1603  arsenical-resistance protein  25.73 
 
 
351 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0159  arsenite efflux transporter ArsB  25 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0303  arsenical-resistance protein  25.1 
 
 
328 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3431  sodium/bile acid symporter family protein  27.09 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000505133  hitchhiker  0.0000000126508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2954  arsenical-resistance protein  24.51 
 
 
350 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0389  arsenical-resistance protein  25.66 
 
 
368 aa  85.9  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26440  arsenical-resistance protein  26.32 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.904411  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0793  arsenical-resistance protein  27.21 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1657  arsenical-resistance protein  26.54 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0604367  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1913  sodium/bile acid symporter family protein  26.76 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000299328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1873  arsenical-resistance protein  25.49 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1771  bile acid:sodium symporter  28.84 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2349  arsenical-resistance protein  25.3 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3222  arsenical-resistance protein  23.45 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1155  arsenical-resistance protein  24.51 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2899  arsenical-resistance protein  24.1 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2964  arsenical-resistance protein  23.45 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1943  sodium/bile acid symporter family protein  27.09 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.63514e-32 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2972  arsenical-resistance protein  23.34 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000703133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3197  arsenical-resistance protein  23.34 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3208  arsenite efflux transporter ArsB  23.78 
 
 
346 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3424  arsenical-resistance protein  27.76 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1749  arsenical-resistance protein  28.09 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000037149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1727  arsenical-resistance protein  27.09 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000732374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3146  arsenical-resistance protein  24.93 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.798277  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0558  arsenical-resistance protein  24.25 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1917  arsenical-resistance protein  23.25 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2013  sodium/bile acid symporter family protein  27.09 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3652  arsenical-resistance protein  23.71 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1992  sodium/bile acid symporter family protein  28.09 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000495919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3202  arsenical-resistance protein  23.45 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2061  arsenical-resistance protein  23.13 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06339  arsenite transporter  23.93 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1769  sodium/bile acid symporter family protein  26.76 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000068477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1907  sodium/bile acid symporter family protein  26.76 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000305377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0939  hypothetical protein  23.08 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4422  arsenical-resistance protein  26.71 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2153  arsenical-resistance protein  26.38 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0841  arsenical-resistance protein  24.51 
 
 
353 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.437226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4497  arsenical-resistance protein  26.91 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2636  arsenical-resistance protein ACR3  23.72 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295985  normal  0.774777 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1702  arsenical-resistance protein ACR3  23.13 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3083  arsenical-resistance protein  26.76 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2920  arsenical-resistance protein  23.45 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000814445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1478  arsenite efflux pump ACR3  24.9 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2684  arsenical-resistance protein  26.23 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0123539  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1578  arsenical-resistance protein  24.51 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1119  arsenical-resistance protein  25.24 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.335014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4497  arsenical-resistance protein  25.08 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2208  arsenical-resistance protein  23.94 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00142179  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1404  arsenical-resistance protein  24.59 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319903  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3134  arsenical-resistance protein  25.08 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79933  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3340  arsenical-resistance protein  25.08 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3187  arsenical-resistance protein  23.14 
 
 
328 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2958  arsenical-resistance protein  24.13 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.610234  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0368  arsenical-resistance protein  24.14 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3744  arsenical-resistance protein  25.65 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.171539  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2991  arsenical-resistance protein  24.14 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0193788  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1289  arsenical-resistance protein  23.62 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0606387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2233  arsenical-resistance protein  25.57 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20620  arsenical-resistance protein  25.55 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0212  arsenical-resistance protein  25.3 
 
 
365 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1555  arsenical-resistance protein ACR3  25.08 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.362934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3325  arsenical-resistance protein  24.31 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3198  arsenical-resistance protein  23.72 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1516  arsenite efflux transporter  25.08 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.404037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1444  arsenical-resistance protein  23.49 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.953895  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0818  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2021  arsenical-resistance protein  24.24 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4018  arsenical-resistance protein  23.7 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2741  arsenical-resistance protein  23.94 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3737  arsenical-resistance protein  25.49 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3643  arsenical-resistance protein  23.38 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0704607  normal  0.350418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3469  arsenical-resistance protein  25.66 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001409  arsenical-resistance protein ACR3  23.57 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0466  arsenical-resistance protein  24.61 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0132809  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2827  arsenical-resistance protein  24.05 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1095  arsenite efflux pump  27.14 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000341702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>