78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2069 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2069  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1950  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.17 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  40.93 
 
 
216 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.18 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.11 
 
 
225 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.64 
 
 
218 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  38.26 
 
 
226 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.47 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.05 
 
 
228 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.53 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.61 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.61 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.41 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.22 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.37 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.44 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3483  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  35.04 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3928  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.16 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0944  dinucleotide-binding protein  28.81 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  29.26 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0788  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.45 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.43 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.25 
 
 
210 aa  62  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  28.49 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.05 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  31.46 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3738  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.77 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.152483  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.12 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  31.76 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  35.68 
 
 
210 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  31.39 
 
 
209 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.89 
 
 
191 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2198  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.11 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  34.38 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  30.53 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5227  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.22 
 
 
198 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308385  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.92 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  33.13 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4020  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.28 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.05 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  30.95 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.16 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3805  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.58 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.215809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  29.31 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  24.19 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.91 
 
 
208 aa  48.1  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0447  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.31 
 
 
251 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.481613  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6559  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.59 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  27.91 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1765  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.94 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3532  dinucleotide-binding protein-like protein  37.63 
 
 
132 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.14 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  31.86 
 
 
222 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2259  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.33 
 
 
233 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2073  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  36.73 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.776412  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  27.03 
 
 
218 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1095  hypothetical protein  28.9 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5868  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.74 
 
 
199 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.770493  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3365  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.67 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4570  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.88 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  29.24 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  24.11 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5289  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.25 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.96 
 
 
289 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2407  hypothetical protein  36.11 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.263259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4463  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.51 
 
 
219 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3140  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.58 
 
 
244 aa  42.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1230  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.28 
 
 
286 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1508  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.82 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.457968  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.7 
 
 
289 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5537  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.89 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115181  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0244  dinucleotide-binding protein  24.87 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11910  predicted dinucleotide-binding enzyme  30.1 
 
 
228 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  25 
 
 
223 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  28.3 
 
 
223 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2767  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.48 
 
 
199 aa  41.6  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.74 
 
 
298 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>