28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1886 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1886  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  263  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2227  hypothetical protein  48.39 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5852  hypothetical protein  47.19 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3442  hypothetical protein  39.08 
 
 
82 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.817468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3781  hypothetical protein  40.45 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5393  hypothetical protein  43.53 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0507  hypothetical protein  43.53 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0426979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5413  hypothetical protein  43.53 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0710032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2871  hypothetical protein  36.96 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0087  hypothetical protein  39.33 
 
 
113 aa  50.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3655  hypothetical protein  42.39 
 
 
80 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0133279  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2926  hypothetical protein  38.54 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5306  hypothetical protein  39.77 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0763794  normal  0.335058 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5703  hypothetical protein  39.77 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.470188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3671  hypothetical protein  38.64 
 
 
84 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00657635  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0444  hypothetical protein  38.2 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1463  hypothetical protein  35.48 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1486  hypothetical protein  35.48 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0475203  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3696  hypothetical protein  42.11 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.90492  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0430  hypothetical protein  37.36 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5733  hypothetical protein  42.11 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5295  hypothetical protein  40.4 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5372  hypothetical protein  44 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0101  hypothetical protein  39.74 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.242091  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5332  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.058385  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5678  hypothetical protein  29.07 
 
 
93 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.339156 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3234  hypothetical protein  40.4 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2741  hypothetical protein  36.9 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.389873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>