27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0369 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0369  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
92 aa  183  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219988  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3483  acyl carrier protein  39.74 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.520778  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2039  acyl carrier protein  39.66 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0051261  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2951  phosphopantetheine-binding protein  36.36 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.765509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1639  phosphopantetheine-binding protein  34.18 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1975  acyl carrier protein  34.21 
 
 
79 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.166506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1263  acyl carrier protein  37.18 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2371  acyl carrier protein  33.78 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3396  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225214  hitchhiker  0.000000113097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6811  phosphopantetheine-binding  39.68 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1325  acyl carrier protein  37.5 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10888  acyl carrier protein  40.38 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4810  acyl carrier protein  37.74 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0303207  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10270  acyl carrier protein  38.78 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.167244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12273  acyl carrier protein  31.58 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.46303  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  28.95 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7056  acyl carrier protein  31.58 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  32.76 
 
 
79 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  29.82 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  29.82 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  29.82 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  29.82 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  39.13 
 
 
2462 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  35.09 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1988  phosphopantetheine-binding  36.92 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44915  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932b  thioesterase  34.62 
 
 
481 aa  40.8  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  29.82 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>