22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4996 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 		 334 aa  687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  45.35 
 
 		 332 aa  288  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  25.95 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.32 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.46 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.6 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295355  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  21.3 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.51 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.04 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  24.45 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.94 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.26 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  24.1 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.15 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.14 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  28 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.75 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.24 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.69 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>