More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3914 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  41.26 
 
 
243 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  41.26 
 
 
243 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  40.89 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  44.25 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  40.89 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  40.89 
 
 
243 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  43.44 
 
 
241 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  40.52 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  41.2 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  40.89 
 
 
243 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  42.8 
 
 
241 aa  196  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  40.08 
 
 
243 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  40.08 
 
 
243 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  40.08 
 
 
243 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  40.08 
 
 
243 aa  192  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  40.08 
 
 
243 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  43.17 
 
 
243 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1611  hypothetical protein  40.93 
 
 
244 aa  189  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000407567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  42.17 
 
 
262 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  42.57 
 
 
262 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  41.77 
 
 
262 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  42.08 
 
 
241 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  181  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  41.67 
 
 
246 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  43.48 
 
 
242 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  38.18 
 
 
243 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  38.18 
 
 
243 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1023  hypothetical protein  43.04 
 
 
244 aa  178  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000164344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  41.05 
 
 
240 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1195  hypothetical protein  40.93 
 
 
235 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0770  hypothetical cytosolic protein  40.93 
 
 
235 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3271  protein of unknown function DUF152  43.04 
 
 
244 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000428401  normal  0.0384904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  41.28 
 
 
248 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0579  hypothetical protein  42.92 
 
 
249 aa  176  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1087  hypothetical protein  42.86 
 
 
244 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000824197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  40.79 
 
 
245 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  39.76 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  41.63 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  39.41 
 
 
244 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1120  hypothetical protein  43.48 
 
 
229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000341688  normal  0.0668952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  43.95 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  42.61 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60200  hypothetical protein  39.83 
 
 
242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000445092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  37.36 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1018  hypothetical protein  42.17 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000015532  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  37.12 
 
 
263 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  42.5 
 
 
278 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  38.79 
 
 
265 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  42.5 
 
 
266 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0084  hypothetical protein  42.5 
 
 
278 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1323  hypothetical protein  42.5 
 
 
278 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0453864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1812  hypothetical protein  42.5 
 
 
278 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5182  hypothetical protein  38.43 
 
 
242 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1083  hypothetical protein  42.08 
 
 
275 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0706778  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2204  hypothetical protein  42.5 
 
 
278 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  35.94 
 
 
242 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0816  protein of unknown function DUF152  40.36 
 
 
242 aa  169  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0879  hypothetical protein  39.82 
 
 
232 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0208806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  40.09 
 
 
244 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  39.91 
 
 
250 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  39.91 
 
 
241 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  36.72 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2345  hypothetical protein  41.98 
 
 
285 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.0176951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  40.09 
 
 
246 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  38.16 
 
 
239 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0828  hypothetical protein  40.69 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0624  hypothetical protein  40.71 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  40.69 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  37.77 
 
 
243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  38.3 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3264  hypothetical protein  40.08 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0664  hypothetical protein  40.09 
 
 
246 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326173  normal  0.173002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2862  hypothetical protein  43.15 
 
 
261 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0229449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2604  hypothetical protein  37.07 
 
 
254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000133256  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3126  protein of unknown function DUF152  38.04 
 
 
260 aa  162  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2564  hypothetical protein  36.59 
 
 
253 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1842  protein of unknown function DUF152  40.74 
 
 
285 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.307663  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0727  hypothetical protein  39.74 
 
 
242 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2557  hypothetical protein  38.57 
 
 
271 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00303813  normal  0.0127768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  38.7 
 
 
240 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0922  hypothetical protein  37.66 
 
 
261 aa  157  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  37.78 
 
 
246 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1482  hypothetical protein  37.59 
 
 
279 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181328  normal  0.125569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  38.14 
 
 
251 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0885  hypothetical protein  38.38 
 
 
243 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0768127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0968  hypothetical protein  36.49 
 
 
279 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0920  protein of unknown function DUF152  35.86 
 
 
254 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  33.45 
 
 
268 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  36.96 
 
 
242 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2475  hypothetical protein  36.29 
 
 
269 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.963175  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  37.83 
 
 
246 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1703  hypothetical protein  39.34 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518116  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  35.69 
 
 
256 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1629  hypothetical protein  38.56 
 
 
267 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6287  hypothetical protein  37.94 
 
 
279 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1792  hypothetical protein  37.94 
 
 
279 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1730  hypothetical protein  39.34 
 
 
279 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5093  hypothetical protein  37.59 
 
 
279 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959032  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>