23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3809 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  33.06 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  35.55 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  32.4 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  28 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  31.05 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  30.96 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  30.42 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  28.29 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  28.17 
 
 		 280 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  26.61 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  25.65 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.05 
 
 		 492 aa  68.9  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.64 
 
 		 433 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.16 
 
 		 430 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 		 383 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  26.81 
 
 		 495 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  24.13 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1535  hypothetical protein  32.09 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.771018  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  28.9 
 
 		 459 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  29.05 
 
 		 426 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 941 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.44 
 
 		 531 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>