20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3363 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3363  hypothetical protein  100 
 
 		 702 aa  1434    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1509  hypothetical protein  41.83 
 
 		 714 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.748736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  41.5 
 
 		 719 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1368  hypothetical protein  41.21 
 
 		 713 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  40.97 
 
 		 702 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  41.72 
 
 		 667 aa  492  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0313  hypothetical protein  39.38 
 
 		 703 aa  487  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0249  hypothetical protein  40.26 
 
 		 621 aa  306  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.216419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02388  hypothetical protein  34.76 
 
 		 703 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 562 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  148  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01506  hypothetical protein  34.14 
 
 		 561 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06248  hypothetical protein  40.6 
 
 		 153 aa  101  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1898 aa  94  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1791  hypothetical protein  42.77 
 
 		 669 aa  91.3  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0011076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  28.46 
 
 		 1003 aa  90.9  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1147 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1441 aa  51.2  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  31.23 
 
 		 3486 aa  47.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  25.52 
 
 		 757 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>