More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3167 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3883  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.37 
 
 
826 aa  807    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0168383  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3167  putative peptidase  100 
 
 
819 aa  1703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0614  dipeptidyl peptidase IV, putative  49.26 
 
 
826 aa  780    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0642  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  49.88 
 
 
826 aa  802    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3700  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  50.37 
 
 
826 aa  810    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000363184  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0807  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  48.67 
 
 
827 aa  793    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000293911  hitchhiker  0.00280594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3195  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  49.51 
 
 
828 aa  790    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2525  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  53.1 
 
 
850 aa  902    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0608  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  49.26 
 
 
826 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00270807  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02195  Dipeptidyl peptidase IV  51.45 
 
 
831 aa  848    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3422  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  49.14 
 
 
826 aa  785    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.286167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.7 
 
 
831 aa  800    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  46.85 
 
 
829 aa  780    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0607  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  49.26 
 
 
826 aa  786    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00770988 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4159  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.36 
 
 
827 aa  803    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.74 
 
 
826 aa  814    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000738695  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3014  dipeptidyl peptidase IV, putative  48.61 
 
 
824 aa  787    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003026  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0568  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.37 
 
 
823 aa  801    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000257692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0576  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50 
 
 
828 aa  793    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.115519  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3933  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40 
 
 
789 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03743  dipeptidyl peptidase  39.72 
 
 
786 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0013  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.76 
 
 
795 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439144  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0015  dipeptidyl-peptidase  38.48 
 
 
795 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2851  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.24 
 
 
811 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.342438  normal  0.410655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1969  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.41 
 
 
787 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.27 
 
 
800 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00782  Dipeptidyl peptidase IV  30.2 
 
 
741 aa  173  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0118527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0785  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  30.89 
 
 
771 aa  170  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.355862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3843  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  29.01 
 
 
771 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.036555  unclonable  0.0000141613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3769  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.14 
 
 
768 aa  169  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000158089  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3662  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.01 
 
 
766 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0549477  hitchhiker  0.000000187493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0677  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.45 
 
 
760 aa  168  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00440025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6185  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.47 
 
 
733 aa  167  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  28.45 
 
 
763 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3720  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.85 
 
 
767 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0109234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  28.31 
 
 
752 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0814  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.14 
 
 
765 aa  165  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000313146  hitchhiker  0.0000639736 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0650  dipeptidyl-peptidase IV  28.23 
 
 
763 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00104928  normal  0.120893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3990  dipeptidyl peptidase IV  28.1 
 
 
763 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3372  dipeptidyl-peptidase IV  29.71 
 
 
763 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0367236  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0774  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.09 
 
 
750 aa  160  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00925268  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.43 
 
 
751 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0732  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.56 
 
 
748 aa  156  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0814063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3968  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  27.18 
 
 
735 aa  154  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.507879  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1057  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.37 
 
 
737 aa  151  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0728154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2985  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like protein  25.8 
 
 
775 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4258  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.46 
 
 
812 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.575828  normal  0.163799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  27.49 
 
 
729 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1419  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  27.48 
 
 
723 aa  147  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04800  dipeptidyl aminopeptidase IV  26.75 
 
 
721 aa  144  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.88 
 
 
741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0532  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.85 
 
 
767 aa  142  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.784675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1409  dipeptidyl-peptidase IV  25.87 
 
 
754 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0754  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.74 
 
 
724 aa  138  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.125402  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0996  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.25 
 
 
771 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0505  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.6 
 
 
709 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3418  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.92 
 
 
738 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0600  dipeptidyl peptidase IV  25.79 
 
 
768 aa  132  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0141822  normal  0.0367187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4504  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.11 
 
 
739 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0503  dipeptidyl aminopeptidase IV  26.57 
 
 
723 aa  129  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.472186 
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  25 
 
 
732 aa  124  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1085  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  26.07 
 
 
718 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.968267  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1151  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  26.37 
 
 
750 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16756  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1241  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.33 
 
 
721 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4028  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.42 
 
 
732 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210313  normal  0.469025 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24120  predicted protein  25.26 
 
 
568 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0056  peptidase S9B, dipeptidylpeptidase IV-like  22.85 
 
 
747 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2692  Dipeptidyl-peptidase IV  24.31 
 
 
772 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00660849  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1624  dipeptidyl-peptidase IV  35.85 
 
 
228 aa  105  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1194  Dipeptidyl-peptidase IV  32.52 
 
 
757 aa  104  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.929099 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0485  putative peptidase  30.73 
 
 
711 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3909  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.77 
 
 
732 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2549  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.31 
 
 
725 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.73 
 
 
688 aa  99  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2538  Dipeptidyl-peptidase IV  23.85 
 
 
1006 aa  97.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3971  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.63 
 
 
671 aa  97.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.330522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.7 
 
 
630 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8451  peptidase, S9B (dipeptidyl peptidase IV) subfamily  30.73 
 
 
689 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.695642  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.85 
 
 
641 aa  94.7  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5023  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.97 
 
 
351 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.31 
 
 
617 aa  92.8  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_002950  PG1004  prolyl oligopeptidase family protein  29.44 
 
 
759 aa  92.4  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23950  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  33.11 
 
 
711 aa  92  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0111668  normal  0.0730472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.76 
 
 
692 aa  91.3  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.14 
 
 
626 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3655  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.26 
 
 
726 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0640869 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02946  Dipeptidyl aminopeptidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI80]  25.34 
 
 
906 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.01 
 
 
626 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.6 
 
 
638 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.01 
 
 
626 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.18 
 
 
636 aa  89  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0561  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.77 
 
 
668 aa  89.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  25.27 
 
 
643 aa  89  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2431  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  32.5 
 
 
735 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474543  normal  0.175702 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2523  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  23.76 
 
 
740 aa  87.4  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603054  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.53 
 
 
682 aa  87.4  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.79 
 
 
682 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04186  dipeptidyl peptidase IV  24.21 
 
 
770 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.804182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.79 
 
 
682 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.79 
 
 
682 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>