More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2108 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2108  glucose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 551 aa  1135    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2735  glucose-6-phosphate isomerase  47.95 
 
 		 545 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000381745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2901  glucose-6-phosphate isomerase  48.7 
 
 		 545 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03322  glucose-6-phosphate isomerase  45.02 
 
 		 549 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.345026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1088  glucose-6-phosphate isomerase  47.66 
 
 		 545 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000310593  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4018  glucose-6-phosphate isomerase  46.13 
 
 		 548 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1279  glucose-6-phosphate isomerase  47.76 
 
 		 545 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000145573  normal  0.0332252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2968  glucose-6-phosphate isomerase  47.4 
 
 		 545 aa  485  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000175964  normal  0.301061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3050  glucose-6-phosphate isomerase  47.4 
 
 		 545 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0740985  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3148  glucose-6-phosphate isomerase  47.4 
 
 		 545 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000357068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1073  glucose-6-phosphate isomerase  46.73 
 
 		 545 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1110  glucose-6-phosphate isomerase  46.93 
 
 		 545 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00275432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3547  glucose-6-phosphate isomerase  47.4 
 
 		 545 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1043  glucose-6-phosphate isomerase  46.55 
 
 		 545 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1144  glucose-6-phosphate isomerase  46.74 
 
 		 545 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0343286  normal  0.608954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3246  glucose-6-phosphate isomerase  46.74 
 
 		 545 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000866912  decreased coverage  0.000837728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1048  glucose-6-phosphate isomerase  46.74 
 
 		 545 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000131328  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16630  glucose-6-phosphate isomerase  43.84 
 
 		 554 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0912  glucose-6-phosphate isomerase  47.49 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0735  glucose-6-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 547 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17650  glucose-6-phosphate isomerase  44.02 
 
 		 554 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0697549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1184  glucose-6-phosphate isomerase  46.28 
 
 		 545 aa  472  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00253768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1006  glucose-6-phosphate isomerase  43.69 
 
 		 547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.777587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1140  glucose-6-phosphate isomerase  44.7 
 
 		 547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.279922  normal  0.256164 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4701  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4566  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 554 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489818  normal  0.0824899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42740  glucose-6-phosphate isomerase  43.66 
 
 		 554 aa  467  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967363  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1339  glucose-6-phosphate isomerase  43.52 
 
 		 548 aa  465  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0803183  unclonable  0.00000158602 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3623  glucose-6-phosphate isomerase  43.99 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1095  glucose-6-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 559 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3594  glucose-6-phosphate isomerase  42.65 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1808  glucose-6-phosphate isomerase  45.58 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.339602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0959  glucose-6-phosphate isomerase  44.93 
 
 		 554 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0826  glucose-6-phosphate isomerase  43.38 
 
 		 554 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0871  Glucose-6-phosphate isomerase  44.59 
 
 		 548 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.881777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1515  glucose-6-phosphate isomerase  44.34 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.447812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0732  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 554 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309434  hitchhiker  0.0000815529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0819  glucose-6-phosphate isomerase  44.91 
 
 		 539 aa  463  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4813  glucose-6-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 554 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167391  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2367  glucose phosphate isomerase  44.66 
 
 		 548 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000694926  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1161  glucose-6-phosphate isomerase  44.89 
 
 		 552 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.149944  normal  0.283638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4700  glucose-6-phosphate isomerase  43.92 
 
 		 554 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0570543  hitchhiker  0.00570528 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0975  glucose-6-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 549 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.307999  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1325  glucose-6-phosphate isomerase  44.61 
 
 		 531 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0252663  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2986  Glucose-6-phosphate isomerase  43.98 
 
 		 541 aa  456  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62620  glucose-6-phosphate isomerase  43.73 
 
 		 554 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1231  Glucose-6-phosphate isomerase  43.99 
 
 		 549 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89106  hitchhiker  0.000628963 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05125  glucose-6-phosphate isomerase  45 
 
 		 545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5449  glucose-6-phosphate isomerase  43.35 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0903  glucose-6-phosphate isomerase  43.33 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144639  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0612  glucose-6-phosphate isomerase  44.7 
 
 		 548 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000038742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0472  glucose-6-phosphate isomerase  44.04 
 
 		 567 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0665  glucose-6-phosphate isomerase  43.05 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.796598  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2063  glucose-6-phosphate isomerase  44.28 
 
 		 560 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1935  glucose-6-phosphate isomerase  43.2 
 
 		 547 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1247  glucose-6-phosphate isomerase  42.6 
 
 		 546 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0280  Glucose-6-phosphate isomerase  43.13 
 
 		 548 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0655697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0481  Glucose-6-phosphate isomerase  44.09 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.734703 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1267  glucose-6-phosphate isomerase  41.27 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1879  glucose-6-phosphate isomerase  43.82 
 
 		 541 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.10773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0938  glucose-6-phosphate isomerase  43.69 
 
 		 549 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0974  glucose-6-phosphate isomerase  42.97 
 
 		 550 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0649451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0995  Glucose-6-phosphate isomerase  43.02 
 
 		 547 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0109  glucose-6-phosphate isomerase  43.45 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0534  glucose-6-phosphate isomerase  42.24 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0373  glucose-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0302  glucose-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.19722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1386  glucose-6-phosphate isomerase  42.91 
 
 		 545 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1859  Glucose-6-phosphate isomerase  40.67 
 
 		 549 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.77335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0143  glucose-6-phosphate isomerase  41.11 
 
 		 541 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3591  glucose-6-phosphate isomerase  42.61 
 
 		 550 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0324  glucose-6-phosphate isomerase  41.51 
 
 		 550 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3918  glucose-6-phosphate isomerase  42.67 
 
 		 548 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002341  glucose-6-phosphate isomerase  42.17 
 
 		 550 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0285  glucose-6-phosphate isomerase  41.54 
 
 		 549 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.542029  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1971  glucose-6-phosphate isomerase  44.17 
 
 		 537 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.799071  normal  0.708924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0299  glucose-6-phosphate isomerase  41.54 
 
 		 549 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.921042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1250  glucose-6-phosphate isomerase  41.77 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2494  Glucose-6-phosphate isomerase  43.14 
 
 		 551 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4477  glucose-6-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 548 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0070  glucose-6-phosphate isomerase  41.95 
 
 		 545 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0137  glucose-6-phosphate isomerase  40.93 
 
 		 541 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.574148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3768  glucose-6-phosphate isomerase  42.91 
 
 		 549 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0385  glucose-6-phosphate isomerase  41.25 
 
 		 550 aa  425  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0369  glucose-6-phosphate isomerase  41.92 
 
 		 549 aa  425  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2030  Glucose-6-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0476253  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00012  glucose-6-phosphate isomerase  41.25 
 
 		 550 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2785  glucose-6-phosphate isomerase  42.17 
 
 		 550 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0501561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5494  Glucose-6-phosphate isomerase  41.79 
 
 		 550 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0138523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1020  glucose-6-phosphate isomerase  44.29 
 
 		 546 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1682  glucose-6-phosphate isomerase  41.71 
 
 		 534 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0419793  normal  0.180807 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23924  isomerase glucose-6-phosphate isomerase  41.45 
 
 		 554 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1940  glucose-6-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 540 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.478064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2735  glucose-6-phosphate isomerase  40.67 
 
 		 547 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076508 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3946  glucose-6-phosphate isomerase  41.79 
 
 		 549 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5218  glucose-6-phosphate isomerase  41.6 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0932  glucose-6-phosphate isomerase  42.94 
 
 		 548 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0922928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1304  glucose-6-phosphate isomerase  40.74 
 
 		 649 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6162  glucose-6-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 556 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1917  glucose-6-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 556 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0173524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>