34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2547 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2547  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  285  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2862  hypothetical protein  98.59 
 
 		 142 aa  280  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0150  thioredoxin domain-containing protein  27.56 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1217  Thioredoxin domain protein  26.51 
 
 		 179 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0855  Fis family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  26.72 
 
 		 391 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24481  thioredoxin-like protein TxlA  23.91 
 
 		 188 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1651  hypothetical protein  30.59 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000147979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1908  Thioredoxin domain protein  31.18 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0411093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1185  Thioredoxin domain  27.66 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0435  thioredoxin domain-containing protein  27.66 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0517  thioredoxin-related protein  28.72 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03201  thioredoxin-like protein TxlA  33.33 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2957  thioredoxin family protein  27.66 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1878  Thioredoxin domain protein  28.89 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0173  hypothetical protein  24.19 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0294  hypothetical protein  26.61 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1608  thioredoxin-like protein TxlA  32.35 
 
 		 189 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2886  thioredoxin domain-containing protein  24.11 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1879  thioredoxin-related  29.35 
 
 		 290 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000713848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2781  thioredoxin  30.12 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.528601  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4910  thioredoxin domain-containing protein  22.73 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4614  thioredoxin domain-containing protein  22.73 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4527  thioredoxin domain-containing protein  22.73 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3645  thioredoxin domain-containing protein  22.58 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.890766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  26.09 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02671  thioredoxin-like protein TxlA  23.91 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1087  Thioredoxin domain protein  21.74 
 
 		 129 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.826113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  27.82 
 
 		 169 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0274  thioredoxin-like protein TxlA  23.21 
 
 		 191 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1025  thioredoxin-related  20.65 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02651  thioredoxin-like protein TxlA  29.85 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3604  thioredoxin domain-containing protein  26.88 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0600  hypothetical protein  25.29 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>