26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0350 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0350  DNA helicase II related protein, putative  100 
 
 		 394 aa  780    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00193946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0359  hypothetical protein  58.45 
 
 		 827 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000526889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001515  hypothetical protein  33.87 
 
 		 634 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.431863  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5264  hypothetical protein  23.02 
 
 		 617 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2139  hypothetical protein  25.61 
 
 		 617 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0738  hypothetical protein  22.03 
 
 		 631 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0076  DNA helicase II  24.03 
 
 		 632 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3682  NERD domain-containing protein  18.97 
 
 		 601 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.023391  normal  0.021571 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  22.7 
 
 		 1136 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1772  DNA helicase II  26.21 
 
 		 619 aa  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1108  hypothetical protein  21.24 
 
 		 593 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39740  DNA helicase  22.77 
 
 		 615 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0820371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4939  DNA helicase II  25.4 
 
 		 613 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.891198  normal  0.619317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3231  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.33 
 
 		 639 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00025834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5380  DNA helicase II  27.88 
 
 		 619 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3262  exonuclease V subunit alpha  44.44 
 
 		 607 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1460  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  48.89 
 
 		 698 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1680  NERD domain-containing protein  30 
 
 		 568 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4619  hypothetical protein  17.89 
 
 		 615 aa  43.5  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502486 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1126  exonuclease V, alpha subunit  40.82 
 
 		 734 aa  43.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00308131  normal  0.011484 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3219  exonuclease V subunit alpha  40 
 
 		 611 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3205  exonuclease V subunit alpha  40 
 
 		 611 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3156  exonuclease V subunit alpha  40 
 
 		 611 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3139  exonuclease V subunit alpha  40 
 
 		 611 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3319  exonuclease V subunit alpha  40 
 
 		 611 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.940485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1299  NERD domain protein  40.91 
 
 		 593 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>