55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1454 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1454  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0480002  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.3 
 
 		 762 aa  98.6  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.94 
 
 		 386 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0028  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.94 
 
 		 386 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 532 aa  81.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  38.39 
 
 		 190 aa  73.6  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0727  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.66 
 
 		 653 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0079  hypothetical protein  35 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  33.96 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0726  hypothetical protein  38.46 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.77 
 
 		 261 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.376264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0525  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.48 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.138389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.46 
 
 		 238 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 		 253 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.97 
 
 		 260 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.81 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2449  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.43 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.07 
 
 		 251 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10117  hypothetical protein  27.34 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1466  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.17 
 
 		 406 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1448  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.17 
 
 		 406 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0464  hypothetical protein  34.38 
 
 		 228 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.767953 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5721  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.96 
 
 		 407 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.517786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3651  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.96 
 
 		 407 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.96 
 
 		 407 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.745209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.96 
 
 		 407 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.070896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0904  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.96 
 
 		 407 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1054  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.62 
 
 		 400 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2045  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.87 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2542  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.93 
 
 		 406 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.17 
 
 		 256 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.76 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28770  hypothetical protein  34.38 
 
 		 399 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.132574 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2614  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.54 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000221676  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.19 
 
 		 270 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3646  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.93 
 
 		 406 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.759222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.25 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.07 
 
 		 433 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3641  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.93 
 
 		 406 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0709667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2328  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.07 
 
 		 433 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580802  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.93 
 
 		 406 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0004  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.36 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0177  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.44 
 
 		 341 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1199  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.57 
 
 		 429 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.134924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5854  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.9 
 
 		 407 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.68 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1844  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.27 
 
 		 218 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.03 
 
 		 328 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.31 
 
 		 254 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0161854  decreased coverage  0.00139428 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0160  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.03 
 
 		 328 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.03 
 
 		 328 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2205  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.65 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1999  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.05 
 
 		 382 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.801779  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  26.47 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1684  hypothetical protein  33.1 
 
 		 446 aa  40.4  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>